RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HAL9	YOL089C	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	BUD25	P85052	153 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YDR248C	Q03786	193 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YPR172W	Q06608	200 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YOR186W	Q08560	144 aa		0.23	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	HUA1	P40325	198 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	FYV6	P53913	173 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.22	□□□□□ -2.37	not detected
HAL9	YOL089C	RSM10	Q03201	203 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	RRT8	Q08219	342 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YET1	P35723	206 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	TVP38	P36164	337 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MRPL28	P36527	147 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	YBR096W	P38256	230 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	PET100	P38958	111 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	NBP35	P52920	328 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	RRN5	Q02983	363 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	LOA1	Q06508	300 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	COQ10	Q08058	207 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MDM32	Q12171	622 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SNA3	P14359	133 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	SSO1	P32867	290 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	DOG2	P38773	246 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	DOG1	P38774	246 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	AVT2	P39981	480 aa		0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
HAL9	YOL089C	MSF1	P08425	469 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YLR156W	P0CE96	114 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YLR159W	P0CE97	114 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YLR161W	P0CE98	114 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	BXI1	P48558	297 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	ALG13	P53178	202 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YNL046W	P53956	172 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	DAD3	P69850	94 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	TRM732	Q03496	1420 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	TIM9	O74700	87 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	COX2	P00410	251 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	URA6	P15700	204 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	ECM4	P36156	370 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YJR079W	P47126	109 aa		0.21	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	VPS15	P22219	1454 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	PDR18	P53756	1333 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	CCA1	P21269	546 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.2	□□□□□ -2.38	not detected
HAL9	YOL089C	SPS18	P32572	300 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	AIM2	P39721	246 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	FMC1	P40491	155 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YJR056C	P47115	236 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	NUP57	P48837	541 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	TOS8	P53147	276 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YNR077C	P53758	84 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	TRM12	Q04235	462 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	CDC123	Q05791	360 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	SEI1	Q06058	285 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	EMP46	Q12396	444 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	IRA1	P18963	3092 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	CDC7	P06243	507 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	POP4	P38336	279 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YNL194C	P40169	301 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	SOK1	P40317	901 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YML108W	Q03759	105 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	LPP1	Q04396	274 aa		0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YGL010W	P25338	174 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RRF1	P38771	230 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	TIR3	P40552	269 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YHR007C-A	Q07074	71 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	JLP1	Q12358	412 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YMR31	P19955	123 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	YBR220C	P38318	560 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	SIP3	P38717	1229 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	GLG2	P47011	380 aa		0.19	□□□□□ -2.38
HAL9	YOL089C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38

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