RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A ATG22P25568 528 aa-0.06□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A PET100P38958 111 aa-0.06□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A HYR1P40581 163 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A DIG2Q03373 323 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A BTS1Q12051 335 aa-0.06□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A TSC3Q3E790 80 aa-0.06□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A YLR156WP0CE96 114 aa-0.07□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A YLR159WP0CE97 114 aa-0.07□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A YLR161WP0CE98 114 aa-0.07□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A MRPL28P36527 147 aa-0.07□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A POP4P38336 279 aa-0.07□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A EAF6P47128 113 aa-0.07□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A LPP1Q04396 274 aa-0.07□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A DAL80P26343 269 aa-0.08□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A VMA22P38784 181 aa-0.08□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A GVP36P40531 326 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A YFH7P43591 353 aa-0.08□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A EMC2P47133 292 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A YMR252CQ04814 134 aa-0.08□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A RAD28Q12021 506 aa-0.08□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A YLR126CQ12288 251 aa-0.08□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A FMP49A0A023PZB3 126 aa-0.09□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A CDC36P06100 191 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A SRB4P32569 687 aa-0.09□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A DOG2P38773 246 aa-0.09□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A PRE6P40303 254 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A SDO1Q07953 250 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
YMR001C-AYMR001C-A MDM35O60200 86 aa-0.1□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A TIM9O74700 87 aa-0.1□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A DBF2P22204 572 aa-0.1□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A CDC10P25342 322 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A RPT5P33297 434 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A YCL042WP25572 119 aa-0.11□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A PRX1P34227 261 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A YBR285WP38354 144 aa-0.11□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A YER034WP40022 185 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A YEL008WP40001 126 aa-0.12□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A MCM22P47167 239 aa-0.12□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A YJR149WP47177 404 aa-0.12□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A YLR460CP54007 376 aa-0.12□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A SED1Q01589 338 aa-0.12□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A TCP1P12612 559 aaKnown RBP-0.13□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A COA3Q3E7B2 85 aa-0.13□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A MSF1P08425 469 aa-0.14□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A MRPL37P36532 105 aa-0.14□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A ERV25P54837 211 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A MCP1Q12106 302 aa-0.14□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A YRA1Q12159 226 aaKnown RBP-0.14□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A SKG1P36169 355 aa-0.15□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A HPA3P39979 161 aa-0.15□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP-0.15□□□□□ -2.43
YMR001C-AYMR001C-A SEC17P32602 292 aa-0.16□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A MRPL15P36523 253 aa-0.16□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A YPL073CP40323 161 aa-0.16□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A HOC1P47124 396 aa-0.16□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A TDA8Q6B2U8 126 aa-0.16□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A PRM8P53174 237 aa-0.17□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A YDR391CQ04170 232 aa-0.17□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A HFA1P32874 2273 aa-0.18□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A ECM4P36156 370 aa-0.18□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A YIL102CP40488 101 aa-0.18□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A YPR203WQ08994 102 aa-0.18□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A DRS2P39524 1355 aa-0.19□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A BCY1P07278 416 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A TRM9P49957 279 aa-0.19□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A NSA1P53136 463 aaPredicted RBP-0.19□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A YDR274CP87283 123 aa-0.19□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A UBC8P28263 218 aa-0.2□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A RPB7P34087 171 aa-0.2□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A UTP30P36144 274 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A RTT105P40063 208 aa-0.2□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A CCW12Q12127 133 aa-0.2□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A SPT3P06844 337 aa-0.21□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A URA5P13298 226 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A CUE1P38428 203 aa-0.21□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A YHL037CP38733 133 aa-0.21□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.21□□□□□ -2.44not detected
YMR001C-AYMR001C-A BNA7Q04066 261 aa-0.21□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A KRE28Q04431 385 aa-0.21□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A OM45P16547 393 aa-0.22□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A BET1P22804 142 aa-0.22□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A SPO13P23624 291 aa-0.22□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A DAD4P69851 72 aa-0.22□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A CDC123Q05791 360 aa-0.22□□□□□ -2.44
YMR001C-AYMR001C-A AHT1P29589 182 aa-0.23□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A TCA17P32613 152 aa-0.23□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A NTF2P33331 125 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A YBR242WP38331 238 aa-0.23□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A FAR7P43592 221 aa-0.23□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A YDR249CQ03787 373 aa-0.23□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A UPS3Q04006 179 aa-0.23□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A YIL177CP40434 1758 aa-0.24□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A YJL225CP40889 1758 aa-0.24□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A MRPL25P23369 157 aa-0.24□□□□□ -2.45
YMR001C-AYMR001C-A MGM101P32787 269 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.3 ms