RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C MED4Q12343 284 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C FMP16Q12497 93 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C SAS5Q99314 248 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C BNI1P41832 1953 aa1.67□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C TIM9O74700 87 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C DSF1P0CX08 502 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YNR073CP0CX09 502 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C TCP1P12612 559 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C DPM1P14020 267 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C IDP1P21954 428 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MAG1P22134 296 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C NTG1P31378 399 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RME1P32338 300 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C JEN1P36035 616 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MRPL17P36528 281 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C HMT1P38074 348 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ECM13P38195 257 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C AIM2P39721 246 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RTT105P40063 208 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C SWM2P40342 146 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MOG1P47123 218 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C HOC1P47124 396 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YJR146WP47174 117 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ARO8P53090 500 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YGL185CP53100 379 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C LSM3P57743 89 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C NUP49Q02199 472 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C TRM44Q02648 567 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MAK3Q03503 176 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YMR166CQ03829 368 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C CSN9Q03981 162 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C BNA7Q04066 261 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C VBA1Q04301 562 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GAL83Q04739 417 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YPR172WQ06608 200 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YOR268CQ08734 132 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YOR214CQ12282 236 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GTT2Q12390 233 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YOS9Q99220 542 aa1.66□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RAD10P06838 210 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RPC40P07703 335 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data1.65□□□□□ -2.15not detected
CSE4YKL049C YSR3P23501 404 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MEK1P24719 497 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YBL010CP32788 280 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CPR5P35176 225 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CLG1P35190 452 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MAK5P38112 773 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C FMP23P38231 175 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C BIG1P38813 335 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SOK1P40317 901 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SNZ3P43545 298 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C BNA6P43619 295 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C LSM8P47093 109 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C AIF1P52923 378 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C EFM5P53200 248 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SNZ2P53824 298 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ASI3P53983 676 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CWC21Q03375 135 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C NHP10Q03435 203 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CGI121Q03705 181 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C CDC123Q05791 360 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C KAP95Q06142 861 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GPI11Q06636 219 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C MHF2Q3E829 80 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SUS1Q6WNK7 96 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa1.65□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RAS2P01120 322 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C STF2P16965 84 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RPS1BP23248 255 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YCR090CP25654 182 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C BUB2P26448 306 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ARO7P32178 256 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SRB6P32570 121 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RPS1AP33442 255 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SKG1P36169 355 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YBR063CP38083 404 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C COS8P38723 381 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RRF1P38771 230 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C IPT1P38954 527 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RMD6P39975 231 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C RGI1P40043 161 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YMR144WP40214 342 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C FIS1P40515 155 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YKE4P40544 346 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C IRC18P47056 224 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YJL016WP47072 561 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C GTR2P53290 341 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ALG11P53954 548 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SLM2P53955 656 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C ERV25P54837 211 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C EGD1Q02642 157 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C PET117Q02771 107 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C SNZ1Q03148 297 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C AIM36Q03798 255 aa1.64□□□□□ -2.15
CSE4YKL049C YOL131WQ08270 108 aa1.64□□□□□ -2.15
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