RNA–Protein interactions for RNA: YHR060W

VMA22, Transcript of Protein that is required for vacuolar H+-ATPase (V-ATPase) function, yeast

Gene VMA22, Length 546 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA22	YHR060W	ATG22	P25568	528 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	AHC2	P25649	128 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	ARO7	P32178	256 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YBR063C	P38083	404 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	MOG1	P47123	218 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	MIG2	P53035	382 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YGR050C	P53231	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	AIM34	Q03673	198 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	LPP1	Q04396	274 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	DYN3	Q04949	312 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	SHH4	Q06236	168 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YLR031W	Q07978	186 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YOL019W	Q08157	551 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YOL160W	Q08321	113 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	MHT1	Q12525	324 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	FLO11	P08640	1367 aa		3.37	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	SCO1	P23833	295 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	CNB1	P25296	175 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	RPB9	P27999	122 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	NUF2	P33895	451 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	MRX8	Q05473	314 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YPL247C	Q12523	523 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		3.36	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	CUP2	P15315	225 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	COX10	P21592	462 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	RCN1	P36054	211 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	POP4	P38336	279 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	BDH1	P39714	382 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YGR042W	P53227	271 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YDC1	Q02896	317 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	IES3	Q12345	250 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	AUS1	Q08409	1394 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	PAN1	P32521	1480 aa		3.35	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YHR139C-A	O13536	103 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	PET54	P10834	293 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	MSA2	P36157	363 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	TVP38	P36164	337 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	AIM2	P39721	246 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	IRC22	P40006	225 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	RPA43	P46669	326 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YPR127W	Q06494	345 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	PRR2	Q12310	699 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	BBP1	Q12365	385 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.34	□□□□□ -1.87
VMA22	YHR060W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	YEL045C	P32616	141 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	YFL012W	P43580	148 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	MDM34	P53083	459 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	HST4	P53688	370 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	ARR2	Q06597	130 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	YPL162C	Q12042	273 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	TAF2	P23255	1407 aa		3.33	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	BET1	P22804	142 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.32	□□□□□ -1.88	not detected
VMA22	YHR060W	ICE2	P40499	491 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	PRM10	P42946	383 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	OST2	P46964	130 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	GAS3	Q03655	524 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	GPI17	Q04080	534 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	DGA1	Q08650	418 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	GEP5	Q12393	293 aa		3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.31	□□□□□ -1.88	not detected
VMA22	YHR060W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	UPS2	P35200	230 aa		3.31	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	MED6	P38782	295 aa		3.31	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	3.31	□□□□□ -1.88	not detected
VMA22	YHR060W	PGU1	P47180	361 aa		3.31	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	YGL204C	P53089	101 aa		3.31	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	PGA1	P53896	198 aa		3.31	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	HAL1	Q01766	294 aa		3.31	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	ATG39	Q06159	398 aa		3.31	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	YKL102C	P34249	101 aa		3.3	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	SGA1	P08019	549 aa		3.29	□□□□□ -1.88
VMA22	YHR060W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88

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