RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
DDI1YER143W RPL43BP0CX26 92 aa7.48□□□□□ -1.21
DDI1YER143W CKA1P15790 372 aa7.48□□□□□ -1.21
DDI1YER143W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
DDI1YER143W COS8P38723 381 aa7.48□□□□□ -1.21
DDI1YER143W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YPL067CQ02754 198 aa7.48□□□□□ -1.21
DDI1YER143W PRM15Q03262 622 aa7.48□□□□□ -1.21
DDI1YER143W ALG6Q12001 544 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
DDI1YER143W TFC7Q12415 435 aa7.48□□□□□ -1.21
DDI1YER143W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YKL187CP34231 750 aa7.47□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YKL107WP34251 309 aa7.47□□□□□ -1.21
DDI1YER143W PRS3P38689 320 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
DDI1YER143W ECM14P38836 430 aa7.47□□□□□ -1.21
DDI1YER143W SIT1P39980 628 aa7.47□□□□□ -1.21
DDI1YER143W PHM8P40025 321 aa7.47□□□□□ -1.21
DDI1YER143W YNL046WP53956 172 aa7.47□□□□□ -1.21
DDI1YER143W FIT1Q04433 528 aa7.47□□□□□ -1.21
DDI1YER143W ERG2P32352 222 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W MNS1P32906 549 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YUH1P35127 236 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W LAG1P38703 411 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W BMT5P40493 336 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YIR035CP40579 254 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W GLR1P41921 483 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W CAC2Q04199 468 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W ORM2Q06144 216 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YCT1Q12235 531 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YDR215CQ12240 137 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YOR029WQ12243 111 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W BBP1Q12365 385 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W HUG1Q6Q5K6 68 aa7.46□□□□□ -1.22
DDI1YER143W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W PAC2P39937 518 aa7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W SYG1P40528 902 aa7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W TAD2P47058 250 aa7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W TEX1P53851 422 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W HSK3P69852 69 aa7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W TSA2Q04120 196 aa7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W SNA4Q07549 140 aa7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YOR292CQ08743 309 aa7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W RTR2Q12378 196 aa7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W FMP16Q12497 93 aa7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YJR112W-AQ3E743 109 aa7.45□□□□□ -1.22
DDI1YER143W MRP20P32387 263 aa7.44□□□□□ -1.22
DDI1YER143W VMA8P32610 256 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
DDI1YER143W GAT2P40209 560 aa7.44□□□□□ -1.22
DDI1YER143W SLM1P40485 686 aa7.44□□□□□ -1.22
DDI1YER143W IRC24P40580 263 aa7.44□□□□□ -1.22
DDI1YER143W LIP2Q06005 328 aa7.44□□□□□ -1.22
DDI1YER143W ANT1Q06497 328 aa7.44□□□□□ -1.22
DDI1YER143W OLE1P21147 510 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W MRS4P23500 304 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W EMP24P32803 203 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W SPC29P33419 253 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W CPR5P35176 225 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W QRI1P43123 477 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YHC3P47040 408 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W SNX4P47057 423 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W BNA2P47125 453 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W XPT1P47165 209 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W JAC1P53193 184 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W VPS28Q02767 242 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W EST3Q03096 181 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W GMC1Q04399 608 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W RIM9Q04734 239 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W RRT7Q07829 113 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W SWT1Q12104 458 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W DGK1Q12382 290 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa7.43□□□□□ -1.22
DDI1YER143W CTR2P38865 189 aa7.42□□□□□ -1.22
DDI1YER143W SWM2P40342 146 aa7.42□□□□□ -1.22
DDI1YER143W PNC1P53184 216 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
DDI1YER143W ACT1P60010 375 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
DDI1YER143W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
DDI1YER143W RFM1Q12192 310 aa7.42□□□□□ -1.22
DDI1YER143W ISN1Q99312 450 aa7.42□□□□□ -1.22
DDI1YER143W MAG1P22134 296 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
DDI1YER143W PDC2P32896 925 aa7.41□□□□□ -1.22
DDI1YER143W VMA7P39111 118 aa7.41□□□□□ -1.22
DDI1YER143W PIR5P46999 287 aa7.41□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YJR012CP47087 207 aa7.41□□□□□ -1.22
DDI1YER143W MEH1Q02205 184 aa7.41□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
DDI1YER143W AEP3Q12089 606 aa7.41□□□□□ -1.22
DDI1YER143W REC104P33323 182 aa7.4□□□□□ -1.22
DDI1YER143W SRY1P36007 326 aa7.4□□□□□ -1.22
DDI1YER143W ERV15P38312 142 aa7.4□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YER121WP40076 114 aa7.4□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YFL015CP43578 164 aa7.4□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YGL262WP53054 175 aa7.4□□□□□ -1.22
DDI1YER143W RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
DDI1YER143W RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
DDI1YER143W YBR255C-AQ3E776 120 aa7.4□□□□□ -1.22
DDI1YER143W BOL1Q3E793 110 aa7.4□□□□□ -1.22
DDI1YER143W CUE1P38428 203 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 156.3 ms