RNA–Protein interactions for RNA: YBR043C

QDR3, Transcript of Multidrug transporter of the major facilitator superfamily, yeast

Gene QDR3, Length 2,070 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
QDR3	YBR043C	YPD1	Q07688	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	YOR376W	Q08900	122 aa		4.91	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	YKR073C	P36153	106 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	SEN34	P39707	275 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	YNR048W	P53740	393 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	YNR066C	P53752	436 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	RSM23	Q01163	450 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	SDC1	Q03323	175 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	YMR082C	Q04276	118 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	HOF1	Q05080	669 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	MDM30	Q05930	598 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	YOR186W	Q08560	144 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	THI72	Q08579	599 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.9	□□□□□ -1.62
QDR3	YBR043C	YCR025C	P25352	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	CLB6	P32943	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	RPB7	P34087	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	MRPL4	P36517	319 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	GET2	P40056	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	BNS1	P50084	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YGL114W	P53134	725 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	FSH2	Q05015	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YOL118C	Q08259	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
QDR3	YBR043C	AGC1	Q12482	902 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	PDX1	P16451	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	VMA3	P25515	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	LAC1	P28496	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	SWD3	P38123	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	POP2	P39008	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	PHB1	P40961	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	SEN15	Q04675	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	ASM4	Q05166	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	TMA17	Q12513	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	COX1	P00401	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	CDC26	P14724	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	SPO13	P23624	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	SSS1	P35179	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	UPS2	P35200	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	UTH1	P36135	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	SLM6	P38343	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	RMD6	P39975	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YIL169C	P40442	995 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	XBP1	P40489	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	HXT14	P42833	540 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	PEF1	P53238	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	HHT1	P61830	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	TRS23	Q03784	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	FRE8	Q12209	686 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	ATG5	Q12380	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	SPS4	P09937	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	MSI1	P13712	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	CDC50	P25656	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	RTS2	P40962	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YGL262W	P53054	175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	POP5	P28005	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	PEX4	P29340	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YBR292C	P38357	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	TOK1	P40310	691 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YDL129W	Q07555	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	TGS1	Q12052	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	SWT1	Q12104	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	FCY22	Q12119	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	PRR2	Q12310	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	SEC59	P20048	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	SLM1	P40485	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	PAU15	P40585	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	PRY1	P47032	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	TAF4	P50105	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	TNA1	P53322	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	NRM1	P53718	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YNL165W	P53891	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	DFG5	Q05031	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	COQ11	Q05892	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	YFH1	Q07540	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
QDR3	YBR043C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.8 ms