RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566180.5

RNPS1-218, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 5

Gene RNPS1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-218ENST00000566180 CDY1Q9Y6F8 540 aa23.18■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 C2CD4DB7Z1M9 353 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 TBC1D4O60343 1298 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 GPR37L1O60883 481 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 LDHAP00338 332 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 NFICP08651 508 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 CASP1P29466 404 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 AFMP43652 599 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.38e-6■■■■■ 52.4
RNPS1-218ENST00000566180 EHHADHQ08426 723 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM132DQ14C87 1099 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 FAM26FQ5R3K3 315 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 APPL2Q8NEU8 664 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 PRKD2Q9BZL6 878 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 PCDHB8Q9UN66 801 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 HPSEQ9Y251 543 aa23.17■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 A0A1B0GVL5 298 aa23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 H7C4K7 107 aa23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 M0QZQ0 153 aa23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 PFKFB1P16118 471 aa23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 TMEM31Q5JXX7 168 aa23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 CCDC149Q6ZUS6 474 aa23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF507Q8TCN5 953 aa23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 CBWD1Q9BRT8 395 aa23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 FAM213AQ9BRX8 229 aa23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 IL18RAPO95256 599 aa23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 HOXD13P35453 343 aa23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 CUL4BQ13620 913 aa23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 LIN9Q5TKA1 542 aa23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 SAAL1Q96ER3 474 aa23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 USP25Q9UHP3 1055 aa23.15■■□□□ 1.3
RNPS1-218ENST00000566180 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 ANO9A1A5B4 782 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 PIRO00625 290 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 PPEF2O14830 753 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 EXTL3O43909 919 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 C8AP07357 584 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 PAX3P23760 479 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 HOXA9P31269 272 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 UVSSAQ2YD98 709 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 C9orf57Q5W0N0 161 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 ARMCX5Q6P1M9 558 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 RTL10Q7L3V2 364 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 NT5DC4Q86YG4 428 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 BRSK2Q8IWQ3 736 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 PLCD3Q8N3E9 789 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 EDAQ92838 391 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 PAGE5Q96GU1 130 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 LRFN3Q9BTN0 628 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 PIDD1Q9HB75 910 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 FBXL5Q9UKA1 691 aa23.14■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 FAM86C2PA6NEL3 165 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 ABLIM3O94929 683 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 LILRA4P59901 499 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 NUCB2P80303 420 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 ROR1Q01973 937 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 CTXN3Q4LDR2 81 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 PPM1LQ5SGD2 360 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF280DQ6N043 979 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 EFCAB13Q8IY85 973 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 PCIF1Q9H4Z3 704 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 C5orf42Q9H799 3197 aa23.13■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 CLUHO75153 1309 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 A0A1W2PQ27 194 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 A0A1W2PQ64 194 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 A0A1W2PQD8 194 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 GOLGA8IPA6NC78 632 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 GOLGA8JA6NMD2 632 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 OAZ2O95190 189 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 WNT7BP56706 349 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 PTPN21Q16825 1174 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 DSTYKQ6XUX3 929 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 GPD1LQ8N335 351 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 SLC7A14Q8TBB6 771 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 SCFD1Q8WVM8 642 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 DPP3Q9NY33 737 aa23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 UBE4BO95155 1302 aa23.11■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 WDR27A2RRH5 827 aa23.11■■□□□ 1.29
RNPS1-218ENST00000566180 SPTLC1O15269 473 aa23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.9 ms