RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 LCTP09848 1927 aa24.07■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 RASGRF2O14827 1237 aa24.07■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 PTP4A2Q12974 167 aa24.07■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 TMEM270Q6UE05 265 aa24.07■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 ARMC9Q7Z3E5 817 aa24.07■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.07■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.07■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 CHMP6Q96FZ7 201 aa24.07■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.07■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 A0A0B4J269 797 aa24.06■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 K7ERI5 159 aa24.06■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 CHKAP35790 457 aa24.06■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 CGRRF1Q99675 332 aa24.06■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 MSTO1Q9BUK6 570 aa24.06■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 FBXO40Q9UH90 709 aa24.06■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 CLTAP09496 248 aa24.05■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 CNTN2Q02246 1040 aa24.05■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 MAMLD1Q13495 774 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 STXBP2Q15833 593 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 MFSD5Q6N075 450 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 OR5B17Q8NGF7 314 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 SNF8Q96H20 258 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 ADAM22Q9P0K1 906 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 MAN1A1P33908 653 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 TAS2R40P59535 323 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 LIN9Q5TKA1 542 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 TRIM72Q6ZMU5 477 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 CPLX4Q7Z7G2 160 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 CNTN6Q9UQ52 1028 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.05■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 RALAP11233 206 aa24.04■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 NOP14P78316 857 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.04■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa24.04■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 SIP14410 1827 aa24.04■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa24.04■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa24.04■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 GRK7Q8WTQ7 553 aa24.04■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 CABS1Q96KC9 395 aa24.04■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa24.03■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 LDHAP00338 332 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 SEZ6Q53EL9 994 aa24.03■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 SEPT14Q6ZU15 432 aa24.03■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.03■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 RHOT1Q8IXI2 618 aa24.03■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.03■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.03■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 NEU2Q9Y3R4 380 aa24.03■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 GAS8O95995 478 aa24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC121Q6ZUS5 278 aa24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 DNERQ8NFT8 737 aa24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 ATL2Q8NHH9 583 aa24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 CCDC114Q96M63 670 aa24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 PCYT2Q99447 389 aa24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 MAF1Q9H063 256 aa24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
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RCCD1-208ENST00000557266 LONRF1Q17RB8 773 aa24.02■■□□□ 1.44
RCCD1-208ENST00000557266 SPRED3Q2MJR0 410 aa24.02■■□□□ 1.44
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