RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA1Q5VX52 437 aa26.02■■□□□ 1.76
SMKR1-201ENST00000462322 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SMKR1-201ENST00000462322 UNC13DQ70J99 1090 aa26.02■■□□□ 1.76
SMKR1-201ENST00000462322 FAM213AQ9BRX8 229 aa26.02■■□□□ 1.76
SMKR1-201ENST00000462322 FBXW11Q9UKB1 542 aa26.02■■□□□ 1.76
SMKR1-201ENST00000462322 DERAQ9Y315 318 aa26.02■■□□□ 1.76
SMKR1-201ENST00000462322 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
SMKR1-201ENST00000462322 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 GARTP22102 1010 aa26.01■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 LIN9Q5TKA1 542 aa26.01■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 CYP26C1Q6V0L0 522 aa26.01■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC149Q6ZUS6 474 aa26.01■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 SAAL1Q96ER3 474 aa26.01■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa26.01■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 C2CD4DB7Z1M9 353 aa26■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 H7C4K7 107 aa26■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 ZMYND10O75800 440 aa26■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 LDHAP00338 332 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 CUL4BQ13620 913 aa26■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa26■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 APPL2Q8NEU8 664 aa26■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 CBWD1Q9BRT8 395 aa26■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa26■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 PIDD1Q9HB75 910 aa26■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHB8Q9UN66 801 aa26■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 C2CD2Q9Y426 696 aa26■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 TCHHQ07283 1943 aa25.99■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 IL18RAPO95256 599 aa25.99■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM31Q5JXX7 168 aa25.99■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 ARMCX5Q6P1M9 558 aa25.99■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa25.99■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 PRKD2Q9BZL6 878 aa25.99■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 PCIF1Q9H4Z3 704 aa25.99■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 USTQ9Y2C2 406 aa25.99■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 C2orf16Q68DN1 1984 aa25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA8IPA6NC78 632 aa25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 FAM86C2PA6NEL3 165 aa25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA8JA6NMD2 632 aa25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 PPEF2O14830 753 aa25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 CTXN3Q4LDR2 81 aa25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 DSTYKQ6XUX3 929 aa25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 PAGE5Q96GU1 130 aa25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 USP25Q9UHP3 1055 aa25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 HPSEQ9Y251 543 aa25.98■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 M0QZQ0 153 aa25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 EXTL3O43909 919 aa25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 C8AP07357 584 aa25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 ARPP19P56211 112 aa25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 NUCB2P80303 420 aa25.97■■□□□ 1.75
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SMKR1-201ENST00000462322 PPM1LQ5SGD2 360 aa25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 C9orf57Q5W0N0 161 aa25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 SLC8B1Q6J4K2 584 aa25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 BRSK2Q8IWQ3 736 aa25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF507Q8TCN5 953 aa25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
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SMKR1-201ENST00000462322 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 FBXL5Q9UKA1 691 aa25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 ANK1P16157 1881 aa25.97■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 TBC1D4O60343 1298 aa25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 GPR37L1O60883 481 aa25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 PAPLNO95428 1278 aa25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
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SMKR1-201ENST00000462322 SYKP43405 635 aa25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 ROR1Q01973 937 aa25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF280DQ6N043 979 aa25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 OTOP3Q7RTS5 596 aa25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 EFCAB13Q8IY85 973 aa25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 PLCD3Q8N3E9 789 aa25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 SLC7A14Q8TBB6 771 aa25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 C11orf16Q9NQ32 467 aa25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 CLUHO75153 1309 aa25.95■■□□□ 1.75
SMKR1-201ENST00000462322 PIRO00625 290 aa25.95■■□□□ 1.74
SMKR1-201ENST00000462322 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SMKR1-201ENST00000462322 NDUFA8P51970 172 aa25.95■■□□□ 1.74
SMKR1-201ENST00000462322 LILRA4P59901 499 aa25.95■■□□□ 1.74
SMKR1-201ENST00000462322 USP37Q86T82 979 aa25.95■■□□□ 1.74
SMKR1-201ENST00000462322 NT5DC4Q86YG4 428 aa25.95■■□□□ 1.74
SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa25.95■■□□□ 1.74
SMKR1-201ENST00000462322 GPD1LQ8N335 351 aa25.95■■□□□ 1.74
SMKR1-201ENST00000462322 FSIP1Q8NA03 581 aa25.95■■□□□ 1.74
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF461Q8TAF7 563 aa25.95■■□□□ 1.74
SMKR1-201ENST00000462322 LRFN3Q9BTN0 628 aa25.95■■□□□ 1.74
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