RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL21RQ9HBE5 538 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OBP2AQ9NY56 170 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPFIA2O75334 1257 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CILPO75339 1184 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALDH1A2O94788 518 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CER1O95813 267 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GNAT2P19087 354 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL8A1P27658 744 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NCAPHQ15003 741 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 METTL13Q8N6R0 699 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GALK1P51570 392 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPC3P51654 580 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP7D2Q96T17 732 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AKT3Q9Y243 479 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AGFG2O95081 481 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLCN3P51790 818 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPHA5P54756 1037 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AMPD2Q01433 879 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TEAD2Q15562 447 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRY1Q16526 586 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HES3Q5TGS1 186 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LEMD2Q8NC56 503 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 P2RY13Q9BPV8 354 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GAREM1Q9H706 876 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 JMJD4Q9H9V9 463 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GMIPQ9P107 970 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A1L4Q6 167 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RECQL4O94761 1208 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APPP05067 770 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR1D2P34982 312 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEFB119Q8N690 84 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC26Q8TAB7 109 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EXOC4Q96A65 974 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC9A2Q9UBY0 812 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1SP09871 688 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GNSP15586 552 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GJA1P17302 382 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CASRP41180 1078 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MATKP42679 507 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM20AQ96MK3 541 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC25A18Q9H1K4 315 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DPYSL4O14531 572 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRK6P43250 576 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACTR2P61160 394 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RUNX3Q13761 415 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTC30AQ86WT1 665 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HS6ST3Q8IZP7 471 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP33Q8TEY7 942 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTC14Q96N46 770 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBN1Q9NPG3 1134 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HPS4Q9NQG7 708 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPAA1O43292 621 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ORC4O43929 436 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCB7O75027 752 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATG7O95352 703 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM87AP0C7U9 286 aa9.62□□□□□ -0.87
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms