RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 COL9A1P20849 921 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 MCM4P33991 863 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 ZXDAP98168 799 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 PTPN21Q16825 1174 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA1Q5VX52 437 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 JADE1Q6IE81 842 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 DERAQ9Y315 318 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 TCHHQ07283 1943 aa22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 UVSSAQ2YD98 709 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 LIN9Q5TKA1 542 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 RTL10Q7L3V2 364 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 APPL2Q8NEU8 664 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 BEST2Q8NFU1 509 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 H7C4K7 107 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 M0QZQ0 153 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 C8AP07357 584 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 HOXA9P31269 272 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 GUCY2FP51841 1108 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 SYCP3Q8IZU3 236 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM206Q9H813 350 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 PIDD1Q9HB75 910 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 C2CD2Q9Y426 696 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 CLUHO75153 1309 aa22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 NFICP08651 508 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 GARTP22102 1010 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 ASIC1P78348 528 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 KRT85P78386 507 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 ROR1Q01973 937 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 HPS3Q969F9 1004 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 LIMD1Q9UGP4 676 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3-201ENST00000392415 ABLIM3O94929 683 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 SCN1AP35498 2009 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 ANO9A1A5B4 782 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR27A2RRH5 827 aa22.31■■□□□ 1.16
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UBE2E3-201ENST00000392415 PPEF2O14830 753 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 IL18RAPO95256 599 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 POU2F2P09086 479 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 PAX3P23760 479 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 EHHADHQ08426 723 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF280DQ6N043 979 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 UNC13DQ70J99 1090 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 SPATA32Q96LK8 384 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 OAZ2O95190 189 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 ASGR2P07307 311 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 CMA1P23946 247 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 LILRA4P59901 499 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 BECN1Q14457 450 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 BRSK2Q8IWQ3 736 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 SAAL1Q96ER3 474 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 BLZF1Q9H2G9 400 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 CCL16O15467 120 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 EXTL3O43909 919 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 XYLBO75191 536 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 SLFN14P0C7P3 912 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 ATF2P15336 505 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 CASP1P29466 404 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 HOXD13P35453 343 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 MTMR3Q13615 1198 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 TPGS2Q68CL5 300 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2E3-201ENST00000392415 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.3■■□□□ 1.16
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