RNA–Protein interactions for RNA: YKL111C

YKL111C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL111C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL111CYKL111C PSF1Q12488 208 aa1.14□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C FCY2P17064 533 aa1.13□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C PET9P18239 318 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C AVT2P39981 480 aa1.13□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YMR144WP40214 342 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C FMC1P40491 155 aa1.13□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C NUP84P52891 726 aa1.13□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YNL010WP53981 241 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C DID2P69771 204 aa1.13□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YLR283WQ05867 314 aa1.13□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C CDC8P00572 216 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C REP2P03872 296 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C SPT3P06844 337 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C BCY1P07278 416 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C MATALPHA1P0CY06 175 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C HMLALPHA1P0CY07 175 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C MRPL25P23369 157 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C SRB4P32569 687 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C SRY1P36007 326 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C AGE2P40529 298 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YIL001WP40560 513 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C RPC17P47076 161 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C ILM1P47155 203 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C TRM9P49957 279 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C MRPL50P53724 139 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C ABF2Q02486 183 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C RRN5Q02983 363 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YML096WQ04489 525 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C MED4Q12343 284 aa1.12□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YOL162WP0CF19 215 aa1.11□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YBR219CP38317 127 aa1.11□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YBR220CP38318 560 aa1.11□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C BOL2P53082 120 aa1.11□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C SML1Q04964 104 aa1.11□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YLR162WQ06235 118 aa1.11□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YGL010WP25338 174 aa1.1□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C CDC10P25342 322 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C URA8P38627 578 aaPredicted RBP1.1□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C ICE2P40499 491 aa1.1□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YRB2P40517 327 aa1.1□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C RPL33BP41056 107 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C BUD25P85052 153 aa1.1□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C PET117Q02771 107 aa1.1□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C CSI2Q08054 341 aa1.1□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YCR016WP25617 290 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C UPS2P35200 230 aa1.09□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YKR045CP36138 183 aa1.09□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C CUE1P38428 203 aa1.09□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data1.09□□□□□ -2.23not detected
YKL111CYKL111C TIR3P40552 269 aa1.09□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C LIA1P47120 325 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C DOC1P53068 250 aa1.09□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data1.09□□□□□ -2.23not detected
YKL111CYKL111C NUP49Q02199 472 aa1.09□□□□□ -2.23
YKL111CYKL111C YPR170W-BP0C5R9 85 aa1.08□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C PGD1P40356 397 aa1.08□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C LPP1Q04396 274 aa1.08□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C YLR156WP0CE96 114 aa1.07□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C YLR159WP0CE97 114 aa1.07□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C YLR161WP0CE98 114 aa1.07□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C TCA17P32613 152 aa1.07□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C YER085CP40058 173 aa1.07□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C AIF1P52923 378 aa1.07□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C RHO1P06780 209 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C URA6P15700 204 aa1.06□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C SEC17P32602 292 aa1.06□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C FZF1P32805 299 aa1.06□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C MSN4P33749 630 aa1.06□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C SIP3P38717 1229 aa1.06□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C DOG2P38773 246 aa1.06□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C PRE6P40303 254 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C MIC26P50087 233 aa1.06□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP1.06□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C CDC28P00546 298 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C POP4P38336 279 aa1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C RTC3P38804 111 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C GAA1P39012 614 aa1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C YNL217WP40152 326 aa1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C RPL13BP40212 199 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C BRR6P53062 197 aa1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C ALG13P53178 202 aa1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C YNR077CP53758 84 aa1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C SWP1Q02795 286 aa1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C YMD8Q03697 442 aa1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C CDC123Q05791 360 aa1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C FLO9P39712 1322 aa1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C PDR18P53756 1333 aa1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C DRS2P39524 1355 aa1.05□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C THP2O13539 261 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C FPR1P20081 114 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
YKL111CYKL111C DBF2P22204 572 aa1.04□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 21.4 ms