RNA–Protein interactions for RNA: YIR015W

RPR2, Transcript of Subunit of nuclear RNase P, yeast

Gene RPR2, Length 435 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPR2	YIR015W	TPK3	P05986	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	CCA1	P21269	546 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	ACB1	P31787	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	COG3	P40094	801 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	YIA6	P40556	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	GDS1	P41913	522 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	PCP1	P53259	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	COS6	P53344	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	RFU1	Q08003	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	ACF2	Q12168	779 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	GEP5	Q12393	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPR2	YIR015W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	PET54	P10834	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	TCA17	P32613	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	MRPL6	P32904	214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YKL063C	P35725	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	RIB5	P38145	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YHR180W	P38868	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	TDA10	P42938	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	TRS85	P46944	698 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	TOS2	P50078	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	MSS11	Q03825	758 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	CTR3	Q06686	241 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	URA6	P15700	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	CPT1	P17898	393 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	ECM15	P35195	104 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	ROT2	P38138	954 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YBR220C	P38318	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	PHB2	P50085	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	RSC9	Q03124	581 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	VBA1	Q04301	562 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	DCN1	Q12395	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	ERD2	P18414	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	VAM7	P32912	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	CLG1	P35190	452 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	APL3	P38065	1025 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YPT10	P38146	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	BDH1	P39714	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YJL016W	P47072	561 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YJR012C	P47087	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	CCC1	P47818	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	MIC26	P50087	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	USE1	P53146	245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	MMS2	P53152	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	ALG13	P53178	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	CAF40	P53829	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YNL095C	P53932	642 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	SCS7	Q03529	384 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	HEM25	Q07534	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	MFG1	Q07684	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	USV1	Q12132	391 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	SFM1	Q12314	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	EXO70	P19658	623 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	UPS2	P35200	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YGR201C	P42936	225 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	MOB2	P43563	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	HMS2	P47175	358 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YGR151C	P53287	111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	YNR066C	P53752	436 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	FMN1	Q03778	218 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	IRC19	Q07843	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	NSL1	Q12143	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	RKI1	Q12189	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	SIR3	P06701	978 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	POF1	P25576	258 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
RPR2	YIR015W	FLO10	P36170	1169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	IST2	P38250	946 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	RBG1	P39729	369 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	SNM1	P40993	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	CHA4	P43634	648 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	UBC11	P52492	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	LST7	P53237	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	IGO1	P53897	168 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	GPI15	P53961	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPR2	YIR015W	ASI3	P53983	676 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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