RNA–Protein interactions for RNA: YHR085W

IPI1, Transcript of Component of the Rix1 complex and possibly pre-replicative complexes, yeast

Gene IPI1, Length 1,005 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IPI1	YHR085W	HEM4	P06174	275 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	GIT1	P25346	518 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	ECM4	P36156	370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	MRPL39	P36533	70 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	CHK1	P38147	527 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	SFH5	P47008	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YDL186W	P48568	277 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	PET191	Q02772	108 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	RAF1	Q06891	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	SPS100	P13130	326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	MDM10	P18409	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	STE18	P18852	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	ARO7	P32178	256 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	ECT1	P33412	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	GWT1	P47026	490 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	COS10	P52924	374 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	AIM36	Q03798	255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	PCL9	Q12477	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	COX5B	P00425	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	DTR1	P38125	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	MDM31	P38880	579 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YER084W	P40057	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	CIN2	P46670	268 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YGL185C	P53100	379 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	MAK3	Q03503	176 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YOP1	Q12402	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	TOA2	P32774	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	VAM7	P32912	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	PEX32	P38292	413 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YHR035W	P38769	630 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	MST28	P39552	234 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	IDP2	P41939	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	POP6	P53218	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YDL114W	Q07530	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	MCT1	Q12283	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	PRB1	P09232	635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	DBF2	P22204	572 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	ZRT3	P34240	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YER184C	P39961	794 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	MNT4	P53745	580 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	HEM25	Q07534	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	GAT3	Q07928	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	RBD2	Q12270	262 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	ITR1	P30605	584 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	MOB2	P43563	287 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	AVT4	P50944	713 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	PAU12	P53343	120 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	MKC7	P53379	596 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	RCE1	Q03530	315 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	MED4	Q12343	284 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YPR1	Q12458	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	FMP16	Q12497	93 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IPI1	YHR085W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	FUN26	P31381	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	YKL187C	P34231	750 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	PAU24	P38155	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	SDS24	P38314	527 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	NVJ1	P38881	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	SIM1	P40472	476 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IPI1	YHR085W	FMC1	P40491	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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