RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	YHR122W	P38829	231 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	GAA1	P39012	614 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YEA6	P39953	335 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ACA1	P39970	489 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	HAT2	P39984	401 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	IRC22	P40006	225 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PUG1	P40100	303 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YER188W	P40103	239 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	RRG9	P40156	214 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YIL152W	P40455	235 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	MOB1	P40484	314 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	BNA1	P47096	177 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SBH2	P52871	88 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	APJ1	P53940	528 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SPP2	Q02521	185 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	OAZ1	Q02803	292 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	GIP3	Q03016	1276 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	UPS3	Q04006	179 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	MRPL1	Q04599	285 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ECM18	Q04623	453 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	CTR3	Q06686	241 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SHS1	Q07657	551 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	BTS1	Q12051	335 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YLR049C	Q12110	428 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PRR2	Q12310	699 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ISA2	Q12425	185 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	RDI1	Q12434	202 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	FRE6	Q12473	712 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TIM9	O74700	87 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	CBS1	P14066	229 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YCR007C	P25354	239 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ATG15	P25641	520 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	OAC1	P32332	324 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ERG3	P32353	365 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MRP49	P32388	137 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.02	□□□□□ -1.93	not detected
ECO1	YFR027W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SDH3	P33421	198 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YKL102C	P34249	101 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	KKQ8	P36004	724 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	GEX2	P36173	615 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MRPS9	P38120	278 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YBR096W	P38256	230 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	WSC4	P38739	605 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MET30	P39014	640 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SPC25	P40014	221 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YER085C	P40058	173 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	COX15	P40086	486 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	COA1	P40452	197 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RMD8	P43620	662 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	IKS1	P47042	667 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	UBX6	P47049	396 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MIC26	P50087	233 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YNL260C	P53846	198 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YNL184C	P53876	108 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RHO4	Q00246	291 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	GOT1	Q03554	138 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MRX8	Q05473	314 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	LOA1	Q06508	300 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MCH1	Q07376	486 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YLR030W	Q07967	263 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	PFA4	Q12006	378 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YDR056C	Q12025	205 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YCT1	Q12235	531 aa		3.02	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SAG1	P20840	650 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YCR023C	P25351	611 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	ADH7	P25377	361 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
ECO1	YFR027W	OCH1	P31755	480 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	MSS51	P32335	436 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	SRB5	P32585	307 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YKL187C	P34231	750 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	LDB7	P38210	180 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	TAE1	P38340	232 aa		3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
ECO1	YFR027W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93

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