RNA–Protein interactions for RNA: HRA1

HRA1, Non-protein-coding RNA, yeast

Gene HRA1, Length 564 nt, Biotype ncRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HRA1	HRA1	LAG1	P38703	411 aa		6.6	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YHR122W	P38829	231 aa		6.6	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	POG1	P40473	351 aa		6.6	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YIL024C	P40543	189 aa		6.6	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	CAF16	P43569	289 aa		6.6	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	RSM23	Q01163	450 aa		6.6	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	ARG5,6	Q01217	863 aa		6.6	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YDC1	Q02896	317 aa		6.6	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YPR063C	Q12160	140 aa		6.6	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	COX5B	P00425	151 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	SCEI	P03882	235 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	AAC1	P04710	309 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	OPI3	P05375	206 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YER190C-B	P0CX94	160 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YFL068W	P0CX99	160 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	PCL1	P24867	279 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	MTH1	P35198	433 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	THI2	P38141	450 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	CDS1	P38221	457 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	ODC1	Q03028	310 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	CAC2	Q04199	468 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	WHI5	Q12416	295 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HRA1	HRA1	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	IES6	P32617	166 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	YBL010C	P32788	280 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	SFK1	P35735	353 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	YPC1	P38298	316 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	SHG1	P38337	142 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	PMT6	P42934	759 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	MRX5	P47007	382 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	SNN1	P48232	102 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	TYW3	P53177	273 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	OKP1	P53298	406 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	YOR385W	Q08909	290 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	PCC1	Q3E833	88 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	CDC7	P06243	507 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	ZRC1	P20107	442 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	FLO10	P36170	1169 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	ERV15	P38312	142 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	OST1	P41543	476 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	QRI7	P43122	407 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	TAD2	P47058	250 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	PHO23	P50947	330 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	DOC1	P53068	250 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	ASI3	P53983	676 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	TY1A-DR2	Q03964	440 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	TY1A-BL	Q12266	440 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	INP53	Q12271	1107 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	VMA9	Q3E7B6	73 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	SUA5	P32579	426 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	TCA17	P32613	152 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	CPR5	P35176	225 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	MCH2	P36032	473 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	PSD1	P39006	500 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	SDP1	P40479	209 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	CAT5	P41735	233 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	PGA1	P53896	198 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	YDL009C	Q12210	107 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	HBN1	Q96VH4	193 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.55	□□□□□ -1.36	not detected
HRA1	HRA1	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	STE18	P18852	110 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	SLM1	P40485	686 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	AGE2	P40529	298 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	SSN8	P47821	323 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	UFD1	P53044	361 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	YGR026W	P53217	278 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	YCL001W-A	P87012	153 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
HRA1	HRA1	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36

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