RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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PTPRB-201ENST00000261266 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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PTPRB-201ENST00000261266 SREBF1P36956 1147 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ANTXR2P58335 489 aa9.49□□□□□ -0.89
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PTPRB-201ENST00000261266 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 PCNX4Q63HM2 1172 aa9.49□□□□□ -0.89
PTPRB-201ENST00000261266 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.49□□□□□ -0.89
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