RNA–Protein interactions for RNA: YOR063W

RPL3, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L3, yeast

Gene RPL3, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL3	YOR063W	YIP1	P53039	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	STD1	Q02794	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	IZH1	Q03419	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	ECM18	Q04623	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	GPN3	Q06543	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	HRT1	Q08273	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	OPI3	P05375	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	CAP2	P13517	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	AHC2	P25649	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	CPR3	P25719	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
RPL3	YOR063W	HSP150	P32478	413 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	ECT1	P33412	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YKL071W	P36086	256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YCR041W	P37265	110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PAU24	P38155	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MAL32	P38158	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MBA1	P38300	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SFH5	P47008	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	IRC18	P47056	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	VOA1	P53262	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SAY1	P53324	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	ERV29	P53337	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MAL12	P53341	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PAU12	P53343	120 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YLR460C	P54007	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	HXT11	P54862	567 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	BUR2	Q05949	395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SEI1	Q06058	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	BTS1	Q12051	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	ORT1	Q12375	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YPR1	Q12458	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	GCN3	P14741	305 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MSK1	P32048	576 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YUH1	P35127	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	RCN1	P36054	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
RPL3	YOR063W	YHR122W	P38829	231 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YHR180W	P38868	163 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	FET3	P38993	636 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YIL024C	P40543	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	YKE4	P40544	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MDV1	P47025	714 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	PMT5	P52867	743 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	TDA1	Q03533	586 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	CAB5	Q03941	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	MCP1	Q12106	302 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	CRC1	Q12289	327 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RPL3	YOR063W	DBF2	P22204	572 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	PMT2	P31382	759 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	DOA4	P32571	926 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	TRS65	P32893	560 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
RPL3	YOR063W	GPX1	P36014	167 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	CHK1	P38147	527 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	FLO5	P38894	1075 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	HPA3	P39979	161 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	DIE2	P50076	525 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	PHB2	P50085	310 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	BRR6	P53062	197 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	COQ10	Q08058	207 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	ATX2	Q12067	313 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	HIS3	P06633	220 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	LSB5	P25369	354 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	PAU2	P32612	120 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	MSN4	P33749	630 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	PEX32	P38292	413 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	DOC1	P53068	250 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	SNX41	Q04053	625 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RPL3	YOR063W	RAX1	Q08760	435 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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