RNA–Protein interactions for RNA: YMR138W

CIN4, Transcript of GTP-binding protein involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeastyeast

Gene CIN4, Length 576 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIN4YMR138W SPO24Q3E752 67 aa5.02□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W Q0297Q9ZZV8 51 aa5.02□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W TDH2P00358 332 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W AAC1P04710 309 aa5.01□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W PET54P10834 293 aa5.01□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W CAP2P13517 287 aa5.01□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W URA6P15700 204 aa5.01□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W RIB7P33312 244 aa5.01□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W RMD6P39975 231 aa5.01□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W PRM5P40476 318 aa5.01□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W MRX5P47007 382 aa5.01□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YMR254CQ04838 102 aa5.01□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YPL199CQ08954 240 aa5.01□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W VMA5P31412 392 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W PRS2P38620 318 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W HPA3P39979 161 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W MIT1P40002 666 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YIL012WP40551 113 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W OTU1P43558 301 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W GON7P46984 123 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W DIE2P50076 525 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W UFD1P53044 361 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W LSM7P53905 115 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YPL067CQ02754 198 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W PEX10Q05568 337 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W UPS1Q05776 175 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YLR283WQ05867 314 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YOR186WQ08560 144 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W ERP4Q12450 207 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W ODC2Q99297 307 aa5□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W URA3P03962 267 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W RFA1P22336 621 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W IMP1P28627 190 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W MTC7P32633 139 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W AGA2P32781 87 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W VAM7P32912 316 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W SPC29P33419 253 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YKL063CP35725 167 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YHR122WP38829 231 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data4.99□□□□□ -1.61not detected
CIN4YMR138W CAT5P41735 233 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W XPT1P47165 209 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W SUT1P53032 299 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W GEP7P53171 287 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W TIM10P87108 93 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W MRPS16Q02608 121 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W WHI5Q12416 295 aa4.99□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W GPM1P00950 247 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W RPL25P04456 142 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W RPL39P04650 51 aa4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W CPR4P25334 318 aa4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W FMT1P32785 401 aa4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W NAT2P37293 288 aa4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YHL044WP38727 235 aa4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W OSH7P38755 437 aa4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YIR020CP40575 100 aa4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W NCA3P46955 337 aa4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W LSM1P47017 172 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W TY1A-MR1Q04215 440 aa4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W SYM1Q06563 197 aa4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W ENV7Q12003 364 aa4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YLR108CQ12259 485 aa4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W GAL1P04385 528 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W CDC23P16522 626 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W TRR1P29509 319 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W OCH1P31755 480 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W CPR5P35176 225 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W GPI18P38211 433 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YKE4P40544 346 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W AIM25P47140 327 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W ABM1P47146 123 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W HNT2P49775 206 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W YGR042WP53227 271 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W FCY22Q12119 530 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W RTR2Q12378 196 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W EAF3Q12432 401 aa4.97□□□□□ -1.61
CIN4YMR138W CDC34P14682 295 aa4.96□□□□□ -1.62
CIN4YMR138W FUS3P16892 353 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CIN4YMR138W YCL042WP25572 119 aa4.96□□□□□ -1.62
CIN4YMR138W ISC10P32645 267 aa4.96□□□□□ -1.62
CIN4YMR138W MIA40P36046 403 aa4.96□□□□□ -1.62
CIN4YMR138W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CIN4YMR138W YBR197CP38306 217 aa4.96□□□□□ -1.62
CIN4YMR138W YER121WP40076 114 aa4.96□□□□□ -1.62
CIN4YMR138W SLM1P40485 686 aa4.96□□□□□ -1.62
CIN4YMR138W SMM1P53720 384 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CIN4YMR138W ECM18Q04623 453 aa4.96□□□□□ -1.62
CIN4YMR138W LIP2Q06005 328 aa4.96□□□□□ -1.62
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