RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C PIR5P46999 287 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C ALB1P47019 175 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C HAM1P47119 197 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C MRPL50P53724 139 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C RPL22BP56628 122 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SPC2Q04969 178 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C INM2Q05533 292 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C COA4Q05809 96 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C BER1Q06688 274 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C GET4Q12125 312 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C ILV1P00927 576 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C CDC33P07260 213 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C KSS1P14681 368 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C NMT1P14743 455 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SEN2P16658 377 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C ICL1P28240 557 aaPredicted RBP1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C KRE6P32486 720 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SSO1P32867 290 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SUR2P38992 349 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C MSS2P40990 351 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C FMP32P43557 207 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C FAR7P43592 221 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C OST3P48439 350 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C NUP84P52891 726 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C CGR1P53188 120 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C PGA2P53903 129 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SWP1Q02795 286 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YPR202WQ08993 238 aa1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C PET494P07390 489 aaPredicted RBP1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C FBA1P14540 359 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C CBF1P17106 351 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RPB4P20433 221 aaPredicted RBP1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C CSM1P25651 190 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ATP7P30902 174 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C TFC1P32367 649 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C KDX1P36005 433 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MRPL40P36534 297 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ETR1P38071 380 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C PDX3P38075 228 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YBR032WP38223 100 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YGP1P38616 354 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C PEX18P38855 283 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C VPS45P38932 577 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C VMA7P39111 118 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YHB1P39676 399 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C THO1P40040 218 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C SER33P40510 469 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C PHB1P40961 287 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C RPS12P48589 143 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MND1P53102 219 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C LSB1P53281 241 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C DML1Q03652 475 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C FMN1Q03778 218 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GPI17Q04080 534 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C PEX10Q05568 337 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GMC2Q06201 188 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C AGC1Q12482 902 aa1.71□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YMR316C-AI2HB70 103 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C UGA1P17649 471 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C PEX3P28795 441 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MEI4P29467 408 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C VPS51P36116 164 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GAA1P39012 614 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C AST2P39945 430 aaKnown RBP1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MNN5P46982 586 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C IBA57P47158 497 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C DSK2P48510 373 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C DIE2P50076 525 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C NBP1P52919 319 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GET1P53192 235 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C FYV6P53913 173 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C COG5P53951 403 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C TIM8P57744 87 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C DID2P69771 204 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YPL039WQ03080 316 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C DYN3Q04949 312 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C YET3Q07451 203 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C PLB3Q08108 686 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C TY3A-GQ12173 290 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ATG31Q12421 196 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C ISD11Q6Q560 94 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C TY3A-IQ99219 290 aa1.7□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C THP2O13539 261 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C BCY1P07278 416 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C GPA2P10823 449 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C SNF4P12904 322 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C NSP1P14907 823 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C MET16P18408 261 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C DBP3P20447 523 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C DBF2P22204 572 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C HSP30P25619 332 aa1.69□□□□□ -2.14
CSE4YKL049C UBC8P28263 218 aa1.69□□□□□ -2.14
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