RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeastyeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4YJL192C ERG27Q12452 347 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
SOP4YJL192C CDC21P06785 304 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C ADH7P25377 361 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C COQ3P27680 312 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C FUN19P28003 413 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C POP5P28005 173 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C LAC1P28496 418 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C MKK1P32490 508 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C NTF2P33331 125 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YKL102CP34249 101 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C ECM15P35195 104 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C ZTA1P38230 334 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C JHD1P40034 492 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C PUG1P40100 303 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YJL068CP40363 299 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C DLS1P40366 167 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C LYS12P40495 371 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C SYS1P41544 203 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C PAM16P42949 149 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C MOB2P43563 287 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C SIP4P46954 829 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C UBX6P47049 396 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YJR012CP47087 207 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C IBA57P47158 497 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C BNS1P50084 137 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YGR117CP53270 476 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YIF1P53845 314 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C PGA1P53896 198 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C MSC1Q03104 513 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C HNT1Q04344 158 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C SEN15Q04675 128 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YMR310CQ04867 317 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C SYM1Q06563 197 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C MRX9Q07349 420 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C CRC1Q12289 327 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C PST1Q12355 444 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YNR034W-AQ3E841 98 aa3.4□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C RPL9AP05738 191 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C ILV5P06168 395 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C MSF1P08425 469 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YOL162WP0CF19 215 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C SCH9P11792 824 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C GPI12P23797 304 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C PUT3P25502 979 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C ADE1P27616 306 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C PEX4P29340 183 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C FMT1P32785 401 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C GSP1P32835 219 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C GSP2P32836 220 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C MSN4P33749 630 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C RRN10P38204 145 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C DBP8P38719 431 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C WSS1P38838 269 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YER010CP40011 234 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C RPL13BP40212 199 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C MET28P40573 187 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C OST3P48439 350 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C AVT4P50944 713 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C RPL9BP51401 191 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YGL114WP53134 725 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C COG7P53195 279 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C SCW4P53334 386 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YNL260CP53846 198 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YNL143CP53908 130 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C RHO4Q00246 291 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YVH1Q02256 364 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YPL014WQ02606 381 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C PIR3Q03180 325 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C TMA23Q03525 211 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C RBS1Q05672 457 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C AIM6Q07716 390 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YLR036CQ07986 203 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C COQ10Q08058 207 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C CRT10Q08226 957 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C FDH1Q08911 376 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C PDH1Q12428 516 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YPR014CQ6B0W2 109 aa3.39□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C KIN28P06242 306 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C ADK1P07170 222 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C STP22P25604 385 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data3.38□□□□□ -1.87not detected
SOP4YJL192C CHK1P38147 527 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C SDS24P38314 527 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C GGC1P38988 300 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C MET30P39014 640 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C FAU1P40099 211 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C GAT2P40209 560 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C AVT7P40501 490 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C OTU1P43558 301 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C PAU5P43575 122 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YJR056CP47115 236 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C ABM1P47146 123 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C UFD1P53044 361 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YGL262WP53054 175 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C YGL235WP53071 178 aa3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SOP4YJL192C SMM1P53720 384 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.4 ms