RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W BMH1P29311 267 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W ATP7P30902 174 aa2.6□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W SPS18P32572 300 aa2.6□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W MRPS9P38120 278 aa2.6□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W IRC18P47056 224 aa2.6□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W TOS8P53147 276 aa2.6□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W EMI1Q04406 187 aa2.6□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W TIM22Q12328 207 aa2.6□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W YAK1P14680 807 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W ERD2P18414 219 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W RME1P32338 300 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W AST1P35183 429 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W ECM4P36156 370 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W YCR087C-AP37263 153 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W TEM1P38987 245 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W SEO1P39709 593 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W SEC72P39742 193 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W ILM1P47155 203 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W BXI1P48558 297 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W YGR067CP53243 804 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W APJ1P53940 528 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W PST1Q12355 444 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W MRX4Q12467 430 aa2.59□□□□□ -1.99
SNX4YJL036W CDC28P00546 298 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W IPP1P00817 287 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W CUP2P15315 225 aa2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W SEC22P22214 214 aa2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W ARC19P33204 171 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W SFC1P33303 322 aa2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W PRY2P36110 329 aa2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
SNX4YJL036W EGD2P38879 174 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W PEX17P40155 199 aa2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W OST3P48439 350 aa2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W DIA1P54005 336 aa2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W MSA1Q08471 629 aa2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W IES3Q12345 250 aa2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W CMC2Q3E7A4 109 aa2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W YBL112CQ3E7Y4 105 aa2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W ISD11Q6Q560 94 aa2.58□□□□□ -2
SNX4YJL036W SRY1P36007 326 aa2.57□□□□□ -2
SNX4YJL036W ECM13P38195 257 aa2.57□□□□□ -2
SNX4YJL036W MMS2P53152 137 aa2.57□□□□□ -2
SNX4YJL036W PDR17P53844 350 aa2.57□□□□□ -2
SNX4YJL036W YDR248CQ03786 193 aa2.57□□□□□ -2
SNX4YJL036W PIN3Q06449 215 aa2.57□□□□□ -2
SNX4YJL036W YPL264CQ08980 353 aa2.57□□□□□ -2
SNX4YJL036W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SNX4YJL036W YPL229WQ99395 206 aa2.57□□□□□ -2
SNX4YJL036W YOL163WP0CF20 169 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W GCN3P14741 305 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W OAC1P32332 324 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W RNP1P32385 249 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W SPL2P38839 148 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W SUR2P38992 349 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W YER189WP40104 122 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W CAT5P41735 233 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W YJL016WP47072 561 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W ERV29P53337 310 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W ALG9P53868 555 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W GIM5Q04493 163 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W GRE1Q08969 168 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W PRR2Q12310 699 aa2.56□□□□□ -2
SNX4YJL036W MET2P08465 486 aa2.55□□□□□ -2
SNX4YJL036W FBA1P14540 359 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNX4YJL036W APS1P35181 156 aa2.55□□□□□ -2
SNX4YJL036W TRR2P38816 342 aa2.55□□□□□ -2
SNX4YJL036W ECO1P43605 281 aa2.55□□□□□ -2
SNX4YJL036W FLC3P53121 802 aa2.55□□□□□ -2
SNX4YJL036W SYF2P53277 215 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SNX4YJL036W ECM11Q04110 302 aa2.55□□□□□ -2
SNX4YJL036W YPL247CQ12523 523 aa2.55□□□□□ -2
SNX4YJL036W SOD1P00445 154 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W SNF6P18888 332 aa2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W ERG24P32462 438 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W YPT52P36018 234 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W CAF4P36130 643 aa2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W MSA2P36157 363 aa2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W MIG2P53035 382 aa2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W MDM34P53083 459 aa2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W YGL159WP53110 370 aa2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W YMR279CQ03263 540 aa2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W YML108WQ03759 105 aa2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W YML096WQ04489 525 aa2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W INM2Q05533 292 aa2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W SMD2Q06217 110 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W BBP1Q12365 385 aa2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W HTL1Q9URQ5 78 aa2.54□□□□□ -2
SNX4YJL036W YLR462WO13556 202 aa2.53□□□□□ -2
SNX4YJL036W MRPL28P36527 147 aa2.53□□□□□ -2
SNX4YJL036W ECM14P38836 430 aa2.53□□□□□ -2
SNX4YJL036W YEL075CP39972 122 aa2.53□□□□□ -2
SNX4YJL036W ERG10P41338 398 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
SNX4YJL036W FAR7P43592 221 aa2.53□□□□□ -2
SNX4YJL036W YFR045WP43617 309 aa2.53□□□□□ -2
SNX4YJL036W PRM8P53174 237 aa2.53□□□□□ -2
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