RNA–Protein interactions for RNA: YDL193W

NUS1, Transcript of Putative prenyltransferase, yeast

Gene NUS1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUS1	YDL193W	NSL1	Q12143	216 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YPL150W	Q12152	901 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YOR304C-A	O14468	76 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	ERD1	P16151	362 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	STE18	P18852	110 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	CNB1	P25296	175 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	PDC2	P32896	925 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	UPS2	P35200	230 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	DER1	P38307	211 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	SRP14	P38985	146 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	PAN6	P40459	309 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	GDS1	P41913	522 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	AIM23	P47015	356 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	SBH2	P52871	88 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	UFD1	P53044	361 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	GET1	P53192	235 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YNL140C	P53910	189 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	SUR7	P54003	302 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	DID2	P69771	204 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YDR476C	Q03362	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	FRQ1	Q06389	190 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YOR214C	Q12282	236 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	IZH2	Q12442	317 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YPR064W	Q12492	139 aa		3.56	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	TFC1	P32367	649 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	CSE2	P33308	149 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	TIP20	P33891	701 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	RIB1	P38066	345 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	ECM13	P38195	257 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	NVJ1	P38881	321 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	AIM18	P38884	321 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YGR210C	P42942	411 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	FAR7	P43592	221 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YJL118W	P47022	219 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	TAD2	P47058	250 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	RPC17	P47076	161 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	MOG1	P47123	218 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	CPD1	P53314	239 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	SAE3	P89114	91 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	VHS1	Q03785	461 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	COA4	Q05809	96 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	PAM18	Q07914	168 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YNG1	Q08465	219 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	FDH1	Q08911	376 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	UIP4	Q08926	304 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	POM33	Q12164	279 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	TFC7	Q12415	435 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	PMD1	P32634	1753 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	QCR7	P00128	127 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	URA6	P15700	204 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	INO2	P26798	304 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	ECM31	P38122	312 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	POP4	P38336	279 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	EFM1	P38732	585 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	PFS1	P38872	237 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	COA1	P40452	197 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	EGT2	P42835	1041 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	SER2	P42941	309 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	ATG18	P43601	500 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	UBC13	P52490	153 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YGL260W	P53056	76 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	CRH1	P53301	507 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	ZRG17	P53735	605 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	CSN9	Q03981	162 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	NDD1	Q08887	554 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	PER33	Q12144	273 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.54	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	LYS2	P07702	1392 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	HTB2	P02294	131 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	TFS1	P14306	219 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	ATG22	P25568	528 aa		3.53	□□□□□ -1.84
NUS1	YDL193W	CPR3	P25719	182 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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