RNA–Protein interactions for RNA: YDL113C

ATG20, Transcript of Sorting nexin family member, yeast

Gene ATG20, Length 1,923 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG20	YDL113C	TAT1	P38085	619 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	UMP1	P38293	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	ECO1	P43605	281 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YJL016W	P47072	561 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	PHB2	P50085	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	RNH201	P53942	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SAM50	P53969	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	MCH4	Q08268	501 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	AAC1	P04710	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	ARG80	P07249	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	PHO2	P07269	559 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	URA6	P15700	204 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	STE4	P18851	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	CPR3	P25719	182 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	MRP17	P28778	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	AVT7	P40501	490 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	PRY1	P47032	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	MSY1	P48527	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	FEX1	Q08913	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	RTR2	Q12378	196 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	ISN1	Q99312	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	FSH3	Q99369	266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	HNM1	P19807	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	ERG8	P24521	451 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	VAM7	P32912	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	KAE1	P36132	386 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SLZ1	P40167	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	IKS1	P47042	667 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	ECM27	P47144	725 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	DID2	P69771	204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YDR209C	Q03480	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	DLT1	Q04216	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	FLO9	P39712	1322 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	AGA2	P32781	87 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	FIG1	P38224	298 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	LOH1	P47055	219 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	NRK1	P53915	240 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YML018C	Q03730	393 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	MCT1	Q12283	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	ATG31	Q12421	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SCEI	P03882	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SPO7	P18410	259 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SUA5	P32579	426 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YKL063C	P35725	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SRY1	P36007	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	GEP4	P38812	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	PEX7	P39108	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	UBP8	P50102	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SLI1	P53304	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	ATG4	P53867	494 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	NRG1	Q03125	231 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	TRM13	Q12383	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	CHO1	P08456	276 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YCR061W	P25639	631 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	COS8	P38723	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	PHB1	P40961	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	CTK2	P46962	323 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SNX4	P47057	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YGL159W	P53110	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	GIM3	P53900	129 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	INN1	P53901	409 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
ATG20	YDL113C	PRM15	Q03262	622 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	COQ11	Q05892	277 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YOR385W	Q08909	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SRL2	Q12020	392 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	RRI1	Q12468	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	REP2	P03872	296 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	SEN2	P16658	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	AFG1	P32317	509 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	POP8	P38208	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YND1	P40009	630 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ATG20	YDL113C	YHC3	P47040	408 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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