RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	DCR2	Q05924	578 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	GAS2	Q06135	555 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	ANT1	Q06497	328 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	SPC3	Q12133	184 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	HAP2	P06774	265 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	MST28	P39552	234 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YPS6	P40583	537 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YHC3	P47040	408 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YJR149W	P47177	404 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	PAC10	P48363	199 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	MDM34	P53083	459 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	HHO1	P53551	258 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	SNO1	Q03144	224 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	KEI1	Q06346	221 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	PPT2	Q12036	173 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	SEC22	P22214	214 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	GPI12	P23797	304 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	LSB5	P25369	354 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	MRP17	P28778	131 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	IKI1	P38874	309 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	CHL4	P38907	458 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	SWM2	P40342	146 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	RFC2	P40348	353 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YIR035C	P40579	254 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	IDP2	P41939	412 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	SAY1	P53324	424 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	PGA1	P53896	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	ARL3	Q02804	198 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	PIR1	Q03178	341 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	BOP2	Q06150	570 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	ARR2	Q06597	130 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	ADE1	P27616	306 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	DTR1	P38125	572 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	LOH1	P47055	219 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	MOG1	P47123	218 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YGL260W	P53056	76 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	EMC4	P53073	190 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	PAU12	P53343	120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	TIM18	Q08749	192 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	AGA1	P32323	725 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	ACP1	P32463	125 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	GAT2	P40209	560 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	BMT5	P40493	336 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	NUP57	P48837	541 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	REX4	Q08237	289 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	LDS1	P31379	325 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	DOA4	P32571	926 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YKL162C	P36052	402 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	MIX23	P38162	196 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	PEX32	P38292	413 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	PRM10	P42946	383 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	MRX5	P47007	382 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YGR042W	P53227	271 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	VHT1	P53241	593 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	PHO2	P07269	559 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	NAM2	P11325	894 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	SGE1	P33335	543 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	ECT1	P33412	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	HMT1	P38074	348 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	PGD1	P40356	397 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	AGX1	P43567	385 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	TOS2	P50078	622 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	OKP1	P53298	406 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	HNT3	Q08702	217 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	PER33	Q12144	273 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	SKS1	Q12505	502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PRD1	YCL057W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.09	□□□□□ -1.75

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