RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518916.5

MSC-AS1-204, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 864 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZACNQ401N2 412 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 SEPT8Q92599 483 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TSPAN18Q96SJ8 248 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADAM2Q99965 735 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 MTMR12Q9C0I1 747 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 CAPN11Q9UMQ6 739 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 DERAQ9Y315 318 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 C2CD2Q9Y426 696 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 HES2Q9Y543 173 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 PTPRJQ12913 1337 aa15.93■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 XPOTO43592 962 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 NFICP08651 508 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ITGA4P13612 1032 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 SLC9A1P19634 815 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 KRT9P35527 623 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZBED6P86452 979 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRPC3Q13507 836 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 DSC3Q14574 896 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 MBTPS1Q14703 1052 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 HS1BP3Q53T59 392 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 WDR44Q5JSH3 913 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 JADE1Q6IE81 842 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 EFCAB13Q8IY85 973 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TAS1R2Q8TE23 839 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 APBB2Q92870 758 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 PGBD4Q96DM1 585 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 KIF12Q96FN5 646 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 NT5C1BQ96P26 610 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 RPS6KC1Q96S38 1066 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 GDF15Q99988 308 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRAIPQ9BWF2 469 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 GANQ9H2C0 597 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TMX1Q9H3N1 280 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 C1orf112Q9NSG2 853 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 RAB20Q9NX57 234 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 APEX2Q9UBZ4 518 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TBX21Q9UL17 535 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 COQ4Q9Y3A0 265 aa15.92■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 HLA-DRAP01903 254 aa15.91■□□□□ 0.14
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MSC-AS1-204ENST00000518916 ACTN1P12814 892 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 AKAP5P24588 427 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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MSC-AS1-204ENST00000518916 NCOA4Q13772 614 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 FMNL3Q8IVF7 1028 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 BEST2Q8NFU1 509 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 OR5B17Q8NGF7 314 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZNF516Q92618 1163 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 FAM81BQ96LP2 452 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 SPAG5Q96R06 1193 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 PANX2Q96RD6 677 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 OSBPL7Q9BZF2 842 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 NLRC4Q9NPP4 1024 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 CNTN3Q9P232 1028 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 FBXL5Q9UKA1 691 aa15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 LAMA3Q16787 3333 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 EPHB6O15197 1021 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 MGEA5O60502 916 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 NBNO60934 754 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 UCHL3P15374 230 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 RFC2P35250 354 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 CCL23P55773 120 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 RAPGEF1Q13905 1077 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 RRAGAQ7L523 313 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 LRRC8AQ8IWT6 810 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 TC2NQ8N9U0 490 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 RNF169Q8NCN4 708 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 SIX2Q9NPC8 291 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 UBN1Q9NPG3 1134 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 RGS18Q9NS28 235 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ABHD10Q9NUJ1 306 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 ITGA11Q9UKX5 1188 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 UMODL1Q5DID0 1318 aa15.9■□□□□ 0.14
MSC-AS1-204ENST00000518916 A0A0U1RQF3 1178 aa15.89■□□□□ 0.13
MSC-AS1-204ENST00000518916 ZNF623O75123 536 aa15.89■□□□□ 0.13
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