RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STAMQ92783 540 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASIC4Q96FT7 647 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BICD1Q96G01 975 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNX27Q96L92 541 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CITO14578 2027 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLDN3O15551 220 aa25.51■■□□□ 1.67
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEZ6Q53EL9 994 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.51■■□□□ 1.67
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAD54LQ92698 747 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZMYND10O75800 440 aa25.5■■□□□ 1.67
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 FGFR3P22607 806 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCKAP1LP55160 1127 aa25.5■■□□□ 1.67
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNH6Q9H252 994 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MUC6Q6W4X9 2439 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 I3L4J1 428 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BRCC3P46736 316 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RESTQ13127 1097 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPECC1Q5M775 1068 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LIN9Q5TKA1 542 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CD300LGQ6UXG3 332 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C3orf58Q8NDZ4 430 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EPSTI1Q96J88 318 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCSER1Q9C0I3 900 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMOC2Q9H3U7 446 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARVGQ9HBI0 331 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNTN3Q9P232 1028 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF318Q5VUA4 2279 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PODXLO00592 558 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADAM12O43184 909 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TKTP29401 623 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR1D2P34982 312 aa25.48■■□□□ 1.67
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FBXW11Q9UKB1 542 aa25.48■■□□□ 1.67
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBX20Q9UMR3 447 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUB1Q9Y5A7 615 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAK2O60296 914 aa25.46■■□□□ 1.67
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAB33AQ14088 237 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKS3Q6ZW76 656 aa25.46■■□□□ 1.67
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNK12Q9HB15 430 aa25.46■■□□□ 1.67
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDY1Q9Y6F8 540 aa25.46■■□□□ 1.67
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 PAPLNO95428 1278 aa25.45■■□□□ 1.66
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 C8AP07357 584 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLTAP09496 248 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CXCL8P10145 99 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TDGQ13569 410 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYADMQ96S97 322 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HAPLN2Q9GZV7 340 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLIQ9UNA4 740 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BACE2Q9Y5Z0 518 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TXLNAP40222 546 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IER5LQ5T953 404 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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