RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460976.5

CTBP2-206, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 5

Gene CTBP2, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-206	ENST00000460976	FGFR3	P22607	806 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	NCKAP1L	P55160	1127 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	GRIN1	Q05586	938 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	28.87	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	REEP2	Q9BRK0	252 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	TRAPPC3	O43617	180 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	ZMYND10	O75800	440 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	KCNE1	P15382	129 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	PLCG1	P19174	1290 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	LRRC15	Q8TF66	581 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	CNTN3	Q9P232	1028 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	TRIO	O75962	3097 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	RAD54L	Q92698	747 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	KCNN1	Q92952	543 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	CLDN3	O15551	220 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	FAM13A	O94988	1023 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	SYT1	P21579	422 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	MCM6	Q14566	821 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	LIN9	Q5TKA1	542 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	BICD1	Q96G01	975 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	MTRR	Q9UBK8	725 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	CLIC4	Q9Y696	253 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	SCP2	P22307	547 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	28.83	■■■□□ 2.21	6e-6	■■■■□ 20.3
CTBP2-206	ENST00000460976	BRCC3	P46736	316 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	MCL1	Q07820	350 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	REST	Q13127	1097 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
CTBP2-206	ENST00000460976	PODXL	O00592	558 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	ADAM12	O43184	909 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	ZNF131	P52739	623 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	RAB33A	Q14088	237 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	PTPA	Q15257	358 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	SEZ6	Q53EL9	994 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	MYCT1	Q8N699	235 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	PARVG	Q9HBI0	331 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976		I3L4J1	428 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976		K7ENM7	598 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	C8A	P07357	584 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	28.81	■■■□□ 2.2	5e-6	■□□□□ 10.5
CTBP2-206	ENST00000460976	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	OR1D2	P34982	312 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	TDG	Q13569	410 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	PRRX2	Q99811	253 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	KCNK12	Q9HB15	430 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	LIG4	P49917	911 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	MYADM	Q96S97	322 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	TBX20	Q9UMR3	447 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	TRAK2	O60296	914 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	CLTA	P09496	248 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	HOXA9	P31269	272 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	NHLH1	Q02575	133 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	IER5L	Q5T953	404 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	EPSTI1	Q96J88	318 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	28.79	■■■□□ 2.2	4e-8	■■■□□ 16
CTBP2-206	ENST00000460976	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
CTBP2-206	ENST00000460976	PIGR	P01833	764 aa		28.78	■■■□□ 2.2

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