RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 CARD9Q9H257 536 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 MCM3APO60318 1980 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 PIK3CAP42336 1068 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 MAPK6Q16659 721 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF484Q5JVG2 852 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 TATDN2Q93075 761 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 EFCC1Q9HA90 598 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP1A2P05177 515 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ACOT2P49753 483 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 CAP1Q01518 475 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 MCL1Q07820 350 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 NNTQ13423 1086 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP2R5EQ16537 467 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 EMBQ6PCB8 327 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR49Q8IV35 697 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 IFT20Q8IY31 132 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 GDF3Q9NR23 364 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa20.02■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 COL1A2P08123 1366 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 CEP104O60308 925 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM189A1O60320 539 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 PRKCBP05771 671 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ARHGAP1Q07960 439 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 OGTO15294 1046 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 GH1P01241 217 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 EDN1P05305 212 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 EPHB4P54760 987 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 DRP2Q13474 957 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ACAD10Q6JQN1 1059 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIM11Q96F44 468 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 COG5Q9UP83 839 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 VNN1O95497 513 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 MMEP08473 750 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 PROZP22891 400 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 BIRC3Q13489 604 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 TAPT1Q6NXT6 567 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 FZD8Q9H461 694 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 MED4Q9NPJ6 270 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 MYBL1P10243 752 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 MARK3P27448 753 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIM50Q86XT4 487 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF149Q8NC42 400 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 CAVIN3Q969G5 261 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLPH3Q9H4A6 298 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 TRPC6Q9Y210 931 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ACKR2O00590 384 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ABLIM1O14639 778 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 MAGEB2O15479 319 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ADORA2AP29274 412 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 DNA2P51530 1060 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 CUL2Q13617 745 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 TAF3Q5VWG9 929 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 PPTC7Q8NI37 304 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 SUGCTQ9HAC7 445 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 CPA4Q9UI42 421 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPRJQ12913 1337 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 CLTAP09496 248 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 KRT5P13647 590 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 OAS2P29728 719 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 WNT7BP56706 349 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 UBL4BQ8N7F7 174 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 HDAC7Q8WUI4 952 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 HTTP42858 3142 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ACO1P21399 889 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms