RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249377.4

LRRC17-201, Transcript of leucine rich repeat containing 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC17, Length 2,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17-201ENST00000249377 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM237Q96Q45 408 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 LRRC42Q9Y546 428 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF536O15090 1300 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 MAPK13O15264 365 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SLURP2P0DP57 97 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 IL9RQ01113 521 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 STAT4Q14765 748 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 DAW1Q8N136 415 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SHC3Q92529 594 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 INPP5DQ92835 1189 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 GMCL1Q96IK5 515 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 NEU2Q9Y3R4 380 aa14.49□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 HIP1RO75146 1068 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 PEX11AO75192 247 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 GAS8O95995 478 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ATF2P15336 505 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 CDC25CP30307 473 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 GCLMP48507 274 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 WDR4P57081 412 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SNX1Q13596 522 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 MOGSQ13724 837 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 TAF11Q15544 211 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 DCLK3Q9C098 648 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 FAM47DPA6NHR8 397 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 CYP26A1O43174 497 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 CHMP2AO43633 222 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 BBOX1O75936 387 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ASMTLO95671 621 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ABHD2P08910 425 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 CALB2P22676 271 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SLC18A1P54219 525 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ALCAMQ13740 583 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 MAML1Q92585 1016 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SAAL1Q96ER3 474 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM206Q9H813 350 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 CHKBQ9Y259 395 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.48□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 F5H6K3 240 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 CYP11B1P15538 503 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 CDR2Q01850 454 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 CENPCQ03188 943 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 NFIAQ12857 509 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SETDB1Q15047 1291 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SPDYAQ5MJ70 313 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 BBOF1Q8ND07 529 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ATL2Q8NHH9 583 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 STK32AQ8WU08 396 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 COA1Q9GZY4 146 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ZFATQ9P243 1243 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 TBK1Q9UHD2 729 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.47□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 C6orf229H3BNL8 230 aa14.46□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 K7ENM7 598 aa14.46□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 ABLIM1O14639 778 aa14.46□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 LINGO3P0C6S8 592 aa14.46□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 MXI1P50539 228 aa14.46□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 NR1H3Q13133 447 aa14.46□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 TNIP1Q15025 636 aa14.46□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.46□□□□□ -0.09
LRRC17-201ENST00000249377 NSMFQ6X4W1 530 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms