RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060125.6

Scn4b-201, Transcript of Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Scn4b, Length 4,982 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Col15a1O35206 1367 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 F830016B08RikG3UWE2 416 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fam178bQ24JP3 464 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Acot6Q32Q92 419 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fam193bQ3U2K0 892 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Adad1Q5SUE7 619 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sin3bQ62141 1098 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Olfr119Q7TRJ5 321 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Unc45bQ8CGY6 931 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zfp566Q8VCI1 386 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Depdc7Q91WS7 511 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 CrebzfQ91ZR3 358 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mis18aQ9CZJ6 204 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Fam162aQ9D6U8 155 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trip4Q9QXN3 581 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Orm2P07361 207 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Akr1b1P45376 316 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Atp6v1b2P62814 511 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Meis1Q60954 390 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Q8BGD0 127 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rev1Q920Q2 1249 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MydgfQ9CPT4 166 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Orc6Q9WUJ8 262 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rgs9bpQ148R9 237 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dmc1Q61880 340 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dpp8Q80YA7 892 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Znf451Q8C0P7 1056 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 ParvaQ9EPC1 372 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm21083A0A0G2JFD5 256 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rnf19bA2A7Q9 732 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 MybP06876 636 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Faf2Q3TDN2 445 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ogfod1Q3U0K8 545 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ip6k2Q80V72 448 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tspan14Q8QZY6 270 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Slc35c2Q8VCX2 364 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Poc5Q9DBS8 558 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pus3Q9JI38 481 aa14.6□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hspa2P17156 633 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Togaram2Q3TYG6 1002 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hdgfl2Q3UMU9 669 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Islr2Q5RKR3 745 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mrps31Q61733 384 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Plk4Q64702 925 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm5414Q6IFZ8 552 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tti1Q91V83 1085 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ndufa5Q9CPP6 116 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Bbs2Q9CWF6 721 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 PgdQ9DCD0 483 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dnajc7Q9QYI3 494 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ankfn1A0A140LIW7 1083 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Kcng1A2BDX4 514 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 A530032D15RikE9Q422 215 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Impdh2P24547 514 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Grid1Q61627 1009 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mettl25Q6NXH8 597 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tarsl2Q8BLY2 790 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Klhl11Q8CE33 709 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Clca1Q9D7Z6 913 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Wdr12Q9JJA4 423 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cdkl2Q9QUK0 568 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Nfu1Q9QZ23 255 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Copg1Q9QZE5 874 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cdr2lA2A6T1 465 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Trappc3O55013 180 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 AdssP46664 456 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 PolgP54099 1218 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tatdn3Q3U1C6 294 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Tmem109Q3UBX0 243 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Chi3l1Q61362 389 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Hsph1Q61699 858 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Mtmr10Q7TPM9 771 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sfr1Q8BP27 319 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Znf426Q8R1D1 550 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rassf7Q9DD19 359 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cyp4f14Q9EP75 524 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Adam22Q9R1V6 904 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Pik3c2bE9QAN8 1632 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 NktrP30415 1453 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Serpinb9O08797 374 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Sept1P42209 366 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Ext2P70428 718 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Celf4Q7TSY6 486 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Rsbn1Q80T69 795 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Cdk17Q8K0D0 523 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Plagl2Q925T4 496 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Psmd9Q9CR00 222 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Stk4Q9JI11 487 aa14.59□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 GakQ99KY4 1305 aa14.58□□□□□ -0.07
Scn4b-201ENSMUST00000060125 Gm4841E9QAA8 417 aa14.58□□□□□ -0.08
Scn4b-201ENSMUST00000060125 OmdO35103 423 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 92.6 ms