Protein–RNA interactions for Protein: P70428

Ext2, Exostosin-2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ext2P70428 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Ext2P70428 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ext2P70428 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ext2P70428 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ext2P70428 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ext2P70428 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ext2P70428 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Ext2P70428 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Ext2P70428 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ext2P70428 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Ext2P70428 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ext2P70428 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Ext2P70428 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ext2P70428 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ext2P70428 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ext2P70428 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Ext2P70428 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ext2P70428 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ext2P70428 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ext2P70428 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ext2P70428 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ext2P70428 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ext2P70428 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ext2P70428 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ext2P70428 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ext2P70428 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ext2P70428 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ext2P70428 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ext2P70428 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ext2P70428 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ext2P70428 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ext2P70428 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ext2P70428 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ext2P70428 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ext2P70428 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ext2P70428 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ext2P70428 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ext2P70428 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ext2P70428 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ext2P70428 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ext2P70428 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Ext2P70428 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ext2P70428 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ext2P70428 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ext2P70428 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ext2P70428 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ext2P70428 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ext2P70428 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ext2P70428 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ext2P70428 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ext2P70428 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ext2P70428 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ext2P70428 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ext2P70428 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ext2P70428 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ext2P70428 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ext2P70428 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Ext2P70428 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ext2P70428 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ext2P70428 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ext2P70428 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ext2P70428 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ext2P70428 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ext2P70428 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ext2P70428 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ext2P70428 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ext2P70428 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ext2P70428 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ext2P70428 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ext2P70428 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ext2P70428 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ext2P70428 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ext2P70428 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ext2P70428 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ext2P70428 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ext2P70428 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ext2P70428 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ext2P70428 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ext2P70428 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ext2P70428 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ext2P70428 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ext2P70428 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ext2P70428 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ext2P70428 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ext2P70428 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ext2P70428 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ext2P70428 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ext2P70428 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ext2P70428 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ext2P70428 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ext2P70428 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ext2P70428 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ext2P70428 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ext2P70428 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ext2P70428 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ext2P70428 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ext2P70428 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ext2P70428 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ext2P70428 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ext2P70428 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms