Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI11

Stk4, Serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk4Q9JI11 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Stk4Q9JI11 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Stk4Q9JI11 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Stk4Q9JI11 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Stk4Q9JI11 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Stk4Q9JI11 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Stk4Q9JI11 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
Stk4Q9JI11 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Stk4Q9JI11 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Stk4Q9JI11 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Stk4Q9JI11 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Stk4Q9JI11 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Stk4Q9JI11 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Stk4Q9JI11 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Stk4Q9JI11 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Stk4Q9JI11 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Stk4Q9JI11 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Stk4Q9JI11 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Stk4Q9JI11 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Stk4Q9JI11 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Stk4Q9JI11 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Stk4Q9JI11 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Stk4Q9JI11 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Stk4Q9JI11 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Stk4Q9JI11 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Stk4Q9JI11 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Stk4Q9JI11 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Stk4Q9JI11 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Stk4Q9JI11 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Stk4Q9JI11 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Stk4Q9JI11 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Stk4Q9JI11 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Stk4Q9JI11 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Stk4Q9JI11 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Stk4Q9JI11 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Stk4Q9JI11 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Stk4Q9JI11 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Stk4Q9JI11 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Stk4Q9JI11 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Stk4Q9JI11 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Stk4Q9JI11 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Stk4Q9JI11 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Stk4Q9JI11 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Stk4Q9JI11 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Stk4Q9JI11 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Stk4Q9JI11 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Stk4Q9JI11 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Stk4Q9JI11 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Stk4Q9JI11 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Stk4Q9JI11 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Stk4Q9JI11 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Stk4Q9JI11 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Stk4Q9JI11 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Stk4Q9JI11 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Stk4Q9JI11 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Stk4Q9JI11 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Stk4Q9JI11 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Stk4Q9JI11 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Stk4Q9JI11 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Stk4Q9JI11 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Stk4Q9JI11 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Stk4Q9JI11 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Stk4Q9JI11 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Stk4Q9JI11 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Stk4Q9JI11 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Stk4Q9JI11 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Stk4Q9JI11 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Stk4Q9JI11 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Stk4Q9JI11 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Stk4Q9JI11 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Stk4Q9JI11 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Stk4Q9JI11 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Stk4Q9JI11 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Stk4Q9JI11 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Stk4Q9JI11 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Stk4Q9JI11 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Stk4Q9JI11 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Stk4Q9JI11 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Stk4Q9JI11 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Stk4Q9JI11 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Stk4Q9JI11 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Stk4Q9JI11 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Stk4Q9JI11 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Stk4Q9JI11 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Stk4Q9JI11 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Stk4Q9JI11 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Stk4Q9JI11 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Stk4Q9JI11 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Stk4Q9JI11 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Stk4Q9JI11 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Stk4Q9JI11 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Stk4Q9JI11 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Stk4Q9JI11 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Stk4Q9JI11 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Stk4Q9JI11 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Stk4Q9JI11 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Stk4Q9JI11 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Stk4Q9JI11 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Stk4Q9JI11 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Stk4Q9JI11 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms