Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYI3

Dnajc7, DnaJ homolog subfamily C member 7, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc7Q9QYI3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Dnajc7Q9QYI3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Dnajc7Q9QYI3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Dnajc7Q9QYI3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Dnajc7Q9QYI3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
Dnajc7Q9QYI3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Dnajc7Q9QYI3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Dnajc7Q9QYI3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Dnajc7Q9QYI3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Dnajc7Q9QYI3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Dnajc7Q9QYI3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Dnajc7Q9QYI3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Dnajc7Q9QYI3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Dnajc7Q9QYI3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Dnajc7Q9QYI3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Dnajc7Q9QYI3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Dnajc7Q9QYI3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Dnajc7Q9QYI3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Dnajc7Q9QYI3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Dnajc7Q9QYI3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Dnajc7Q9QYI3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Dnajc7Q9QYI3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Dnajc7Q9QYI3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Dnajc7Q9QYI3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Dnajc7Q9QYI3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Dnajc7Q9QYI3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Dnajc7Q9QYI3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Dnajc7Q9QYI3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Dnajc7Q9QYI3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Dnajc7Q9QYI3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Dnajc7Q9QYI3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Dnajc7Q9QYI3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Dnajc7Q9QYI3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Dnajc7Q9QYI3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Dnajc7Q9QYI3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Dnajc7Q9QYI3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Dnajc7Q9QYI3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Dnajc7Q9QYI3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Dnajc7Q9QYI3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Dnajc7Q9QYI3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Dnajc7Q9QYI3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Dnajc7Q9QYI3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Dnajc7Q9QYI3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Dnajc7Q9QYI3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Dnajc7Q9QYI3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Dnajc7Q9QYI3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Dnajc7Q9QYI3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Dnajc7Q9QYI3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Dnajc7Q9QYI3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Dnajc7Q9QYI3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Dnajc7Q9QYI3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Dnajc7Q9QYI3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Dnajc7Q9QYI3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Dnajc7Q9QYI3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Dnajc7Q9QYI3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Dnajc7Q9QYI3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Dnajc7Q9QYI3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Dnajc7Q9QYI3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Dnajc7Q9QYI3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Dnajc7Q9QYI3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Dnajc7Q9QYI3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Dnajc7Q9QYI3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Dnajc7Q9QYI3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Dnajc7Q9QYI3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Dnajc7Q9QYI3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Dnajc7Q9QYI3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Dnajc7Q9QYI3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Dnajc7Q9QYI3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Dnajc7Q9QYI3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Dnajc7Q9QYI3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Dnajc7Q9QYI3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Dnajc7Q9QYI3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Dnajc7Q9QYI3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Dnajc7Q9QYI3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Dnajc7Q9QYI3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Dnajc7Q9QYI3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Dnajc7Q9QYI3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Dnajc7Q9QYI3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Dnajc7Q9QYI3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Dnajc7Q9QYI3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Dnajc7Q9QYI3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Dnajc7Q9QYI3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Dnajc7Q9QYI3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Dnajc7Q9QYI3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Dnajc7Q9QYI3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Dnajc7Q9QYI3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Dnajc7Q9QYI3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Dnajc7Q9QYI3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Dnajc7Q9QYI3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Dnajc7Q9QYI3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Dnajc7Q9QYI3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Dnajc7Q9QYI3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Dnajc7Q9QYI3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Dnajc7Q9QYI3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Dnajc7Q9QYI3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Dnajc7Q9QYI3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Dnajc7Q9QYI3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Dnajc7Q9QYI3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Dnajc7Q9QYI3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Dnajc7Q9QYI3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms