RNA–Protein interactions for RNA: YPR036W

VMA13, Transcript of Subunit H of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA13, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA13	YPR036W	ARO7	P32178	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SFC1	P33303	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	UPS2	P35200	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RRG9	P40156	214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	STB1	P42845	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	FHN1	P53279	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RHO4	Q00246	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MAK3	Q03503	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	OST6	Q03723	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YPR127W	Q06494	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	BSC1	Q12140	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SLH1	P53327	1967 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YLR415C	O13578	112 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	TFS1	P14306	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	DBF2	P22204	572 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SRL3	P36167	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RIB5	P38145	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MBB1	P39534	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MOG1	P47123	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	COQ5	P49017	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	NIF3	P53081	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	NRG1	Q03125	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SIZ1	Q04195	904 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YML096W	Q04489	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	FRE7	Q12333	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.87	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MET2	P08465	486 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	PET54	P10834	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	URA6	P15700	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	PPH21	P23594	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	HSP30	P25619	332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	OAC1	P32332	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	GPX2	P38143	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SDH8	P38345	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	BDH1	P39714	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SNM1	P40993	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MSY1	P48527	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SNO1	Q03144	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	BBP1	Q12365	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MDM35	O60200	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	POP5	P28005	173 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YKR073C	P36153	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	WSC4	P38739	605 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	DDI1	P40087	428 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	IDP2	P41939	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	CIN2	P46670	268 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	CPR8	P53728	308 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YNR066C	P53752	436 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	ASR1	Q06834	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MMT2	Q08970	484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RKM5	Q12367	367 aa		4.85	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	COX1	P00401	534 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	KIN28	P06242	306 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	NAM2	P11325	894 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	BUB3	P26449	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
VMA13	YPR036W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	FMP23	P38231	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YHK8	P38776	514 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
VMA13	YPR036W	YAL037W	P39728	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	FMP52	P40008	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	BMT5	P40493	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	YPS6	P40583	537 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RTS2	P40962	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	AIM24	P47127	394 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MGA1	P53050	456 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	ATG4	P53867	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	SOR2	Q07786	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	RNH203	Q12338	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
VMA13	YPR036W	TRA1	P38811	3744 aa		4.84	□□□□□ -1.64
VMA13	YPR036W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
VMA13	YPR036W	RNQ1	P25367	405 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.4 ms