RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C SMD2Q06217 110 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SEC10Q06245 871 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C GGA1Q06336 557 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C ASR1Q06834 288 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YLL007CQ07799 665 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C DAS2Q12084 232 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C ADF1Q2V2Q1 113 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C TY4B-HP0C2J7 1802 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C TY4B-JP47024 1803 aa1.77□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C FAS2P19097 1887 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C TUS1Q06412 1307 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SNA3P14359 133 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C POL30P15873 258 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C MED6P38782 295 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C VMA22P38784 181 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SHC1P39000 512 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SEN34P39707 275 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YIA6P40556 373 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C FMP33P46998 180 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C GLG2P47011 380 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C RMR1P53060 241 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YNL247WP53852 767 aaKnown RBP1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SWT21P53873 357 aaPredicted RBP1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YDR476CQ03362 224 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YMR209CQ03648 457 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C TVP15Q03860 143 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C TAF9Q05027 157 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YOR114WQ12219 294 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C EMP46Q12396 444 aa1.76□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YLR462WO13556 202 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C ATP6P00854 259 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C HIS3P06633 220 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C CMD1P06787 147 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C TFS1P14306 219 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SNF6P18888 332 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C VPS3P23643 1011 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SUA5P32579 426 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C COY1P34237 679 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C ATG12P38316 186 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C HSM3P38348 480 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C HIS2P38635 335 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YHL049CP38722 271 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C TRM5P38793 499 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YEL075CP39972 122 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YER189WP40104 122 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SMX2P40204 77 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C EMC2P47133 292 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C GTO1P48239 356 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C TPN1P53099 579 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C COG7P53195 279 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SRL4Q03085 281 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YML018CQ03730 393 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YML108WQ03759 105 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C FUS2Q05670 677 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C UIP4Q08926 304 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C POM33Q12164 279 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C ATG5Q12380 294 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YIL177CP40434 1758 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YJL225CP40889 1758 aa1.75□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C RSF2P46974 1380 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C GAL7P08431 366 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C RSR1P13856 272 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C GPI12P23797 304 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C COT1P32798 439 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SPT4P32914 102 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C RPT5P33297 434 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C UTP11P34247 250 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C VPS21P36017 210 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C POP4P38336 279 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C NPT1P39683 429 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C PCL7P40186 285 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C AGP3P43548 558 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C LOC1P43586 204 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C RPE1P46969 238 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C LIA1P47120 325 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C KEL2P50090 882 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C USE1P53146 245 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C ORM1P53224 222 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SSU72P53538 206 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C GPN3Q06543 272 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data1.74□□□□□ -2.13not detected
CSE4YKL049C YLR053CQ12026 108 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C MDY2Q12285 212 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C BBP1Q12365 385 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C RIM15P43565 1770 aa1.74□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C COQ1P18900 473 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C MAK31P23059 88 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C RRT12P25381 491 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C BUD23P25627 275 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C ATG15P25641 520 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C MGT1P26188 188 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C ERG2P32352 222 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C CAT2P32796 670 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SRL3P36167 246 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C POP8P38208 133 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C YBR242WP38331 238 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C PHO89P38361 574 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C SPL2P38839 148 aa1.73□□□□□ -2.13
CSE4YKL049C FCY21P40039 528 aa1.73□□□□□ -2.13
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