RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	RSM23	Q01163	450 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RTC3	YHR087W	KAP120	Q02932	1032 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RTC3	YHR087W	PRM15	Q03262	622 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RTC3	YHR087W	MCT1	Q12283	360 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RTC3	YHR087W	BBP1	Q12365	385 aa		13.29	□□□□□ -0.28
RTC3	YHR087W	SGA1	P08019	549 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RTC3	YHR087W	AFG1	P32317	509 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RTC3	YHR087W	CIN2	P46670	268 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RTC3	YHR087W	RNH201	P53942	307 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RTC3	YHR087W	ARG5,6	Q01217	863 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RTC3	YHR087W	YDR387C	Q04162	555 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RTC3	YHR087W	PRM4	Q12498	284 aa		13.28	□□□□□ -0.28
RTC3	YHR087W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	PPZ2	P33329	710 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	AIM46	P38885	310 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	PRY1	P47032	299 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	ATG4	P53867	494 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.27	□□□□□ -0.29	not detected
RTC3	YHR087W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		13.27	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	PHO2	P07269	559 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	HNM1	P19807	563 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	MRPL19	P53875	158 aa		13.26	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	DSF1	P0CX08	502 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	YNR073C	P0CX09	502 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	FMT1	P32785	401 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	VMA7	P39111	118 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	CTK2	P46962	323 aa		13.25	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	YPC1	P38298	316 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	MGE1	P38523	228 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	GEP4	P38812	185 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	YGL159W	P53110	370 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	FMP16	Q12497	93 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	PET20	Q99373	253 aa		13.24	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	COX5B	P00425	151 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	IFM1	P25038	676 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	QDR1	P40475	563 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	PHB2	P50085	310 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	SKP1	P52286	194 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	SCY1	P53009	804 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	SYM1	Q06563	197 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.22	□□□□□ -0.29	not detected
RTC3	YHR087W	AAC1	P04710	309 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	MTC7	P32633	139 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	YNR048W	P53740	393 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	ATG31	Q12421	196 aa		13.22	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	RPB10	P22139	70 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	PCL1	P24867	279 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	SED4	P25365	1065 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	AVT4	P50944	713 aa		13.21	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
RTC3	YHR087W	YJL016W	P47072	561 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	YML018C	Q03730	393 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	FEX1	Q08913	375 aa		13.2	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	YCR061W	P25639	631 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	SUA5	P32579	426 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	MRPL36	P36531	177 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	MRPL39	P36533	70 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	MOB2	P43563	287 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	SPR28	Q04921	423 aa		13.19	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	SEN2	P16658	377 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.18	□□□□□ -0.3	not detected
RTC3	YHR087W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	NIF3	P53081	288 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	TNA1	P53322	534 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	COQ11	Q05892	277 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	YDL180W	Q12301	547 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	IZH2	Q12442	317 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		13.18	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	MCM1	P11746	286 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	VAM7	P32912	316 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	YIL169C	P40442	995 aa		13.17	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
RTC3	YHR087W	OKP1	P53298	406 aa		13.17	□□□□□ -0.3

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