RNA–Protein interactions for RNA: YER127W

LCP5, Essential protein involved in maturation of 18S rRNA, yeast

Gene LCP5, Length 1,074 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCP5	YER127W	YOL024W	Q08172	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	TFC7	Q12415	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	UBR1	P19812	1950 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	MRPL37	P36532	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	YPC1	P38298	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	TCD1	P38756	429 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	KEL2	P50090	882 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LCP5	YER127W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	PPQ1	P32945	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	ZRT3	P34240	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	LDB7	P38210	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YHR045W	P38775	560 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	MEP1	P40260	492 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YGR067C	P53243	804 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YNL260C	P53846	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	LAG2	Q92325	660 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
LCP5	YER127W	YKL063C	P35725	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YKL070W	P36087	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	TDA11	P38854	504 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	SLM1	P40485	686 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	GTO1	P48239	356 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	PET117	Q02771	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	MRX8	Q05473	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	BCP1	Q06338	283 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	ASR1	Q06834	288 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	RSR1	P13856	272 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	POP4	P38336	279 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YEL073C	P39974	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	SCC4	P40090	624 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	GMC1	Q04399	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YDL012C	Q12489	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YSR3	P23501	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	RTT105	P40063	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	AGP3	P43548	558 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	RPC17	P47076	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	UBC13	P52490	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	OSH6	Q02201	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	VIK1	Q12045	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	COX10	P21592	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	IME2	P32581	645 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	MRPL15	P36523	253 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	RRG9	P40156	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	RAD10	P06838	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	SFC1	P33303	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	PEX18	P38855	283 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	GDS1	P41913	522 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	MIC19	P43594	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YGL118C	P53132	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	TRM12	Q04235	462 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	GPN3	Q06543	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	POM33	Q12164	279 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	IFM1	P25038	676 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YBR062C	P38239	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	VTI1	Q04338	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	ECM19	Q06011	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	FMP16	Q12497	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LCP5	YER127W	RPC37	P36121	282 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	FRT2	P39734	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	YIA6	P40556	373 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	NHP10	Q03435	203 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	YDR278C	Q05612	105 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	ATP6	P00854	259 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	GPA2	P10823	449 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	MGT1	P26188	188 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	GPX1	P36014	167 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	TPO5	P36029	618 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	BDH1	P39714	382 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	CAX4	P53223	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	SPP2	Q02521	185 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LCP5	YER127W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64

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