RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W SCEIP03882 235 aa11.48□□□□□ -0.57
SSA4YER103W PET18P25362 215 aa11.48□□□□□ -0.57
SSA4YER103W MTC7P32633 139 aa11.48□□□□□ -0.57
SSA4YER103W NIT3P49954 291 aa11.48□□□□□ -0.57
SSA4YER103W ACS2P52910 683 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SSA4YER103W NRG1Q03125 231 aa11.48□□□□□ -0.57
SSA4YER103W YNR034W-AQ3E841 98 aa11.48□□□□□ -0.57
SSA4YER103W SPS4P09937 338 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W MATALPHA1P0CY06 175 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W HMLALPHA1P0CY07 175 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W SLY41P22215 453 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W FAT1P38225 669 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W NEM1P38757 446 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W SUR2P38992 349 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W YEA6P39953 335 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W SLZ1P40167 298 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W MOB2P43563 287 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W SEH1P53011 349 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W YML018CQ03730 393 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W CAB5Q03941 241 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W YLR456WQ06199 204 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W YPR014CQ6B0W2 109 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W PRO1P32264 428 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W ISF1P32488 338 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W RRP3P38712 501 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W HEM14P40012 539 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W TEX1P53851 422 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W MMP1Q12372 583 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W AGC1Q12482 902 aa11.47□□□□□ -0.57
SSA4YER103W RIP1P08067 215 aa11.46□□□□□ -0.58
SSA4YER103W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data11.46□□□□□ -0.58not detected
SSA4YER103W ERG1P32476 496 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
SSA4YER103W TIM12P32830 109 aa11.46□□□□□ -0.58
SSA4YER103W VBA2P38358 474 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
SSA4YER103W NOP16P40007 231 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
SSA4YER103W RRD1P40454 393 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
SSA4YER103W VEL1P53058 206 aa11.46□□□□□ -0.58
SSA4YER103W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
SSA4YER103W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
SSA4YER103W YOR114WQ12219 294 aa11.46□□□□□ -0.58
SSA4YER103W ASK10P48361 1146 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W YGL262WP53054 175 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W PDR16P53860 351 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W YDC1Q02896 317 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W YDR248CQ03786 193 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SRO7Q12038 1033 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SRF1Q12516 437 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W MRPS9P38120 278 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W RPP1P38786 293 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W IKS1P47042 667 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W RTT103Q05543 409 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W YPL272CQ08984 517 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W YOR015WQ12169 119 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W FYV7Q12247 151 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W MPD2Q99316 277 aa11.45□□□□□ -0.58
SSA4YER103W MET3P08536 511 aa11.44□□□□□ -0.58
SSA4YER103W EHD3P28817 500 aa11.44□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SEF1P34228 1148 aa11.44□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SPT23P35210 1082 aa11.44□□□□□ -0.58
SSA4YER103W TRS20P38334 175 aa11.44□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SCW4P53334 386 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SSA4YER103W OGG1P53397 376 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SSA4YER103W NDE2Q07500 545 aa11.44□□□□□ -0.58
SSA4YER103W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data11.43□□□□□ -0.58not detected
SSA4YER103W ASM4Q05166 528 aa11.43□□□□□ -0.58
SSA4YER103W NPR1P22211 790 aa11.43□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SLC1P33333 303 aa11.43□□□□□ -0.58
SSA4YER103W PTC7P38797 343 aa11.43□□□□□ -0.58
SSA4YER103W UIP3P39547 235 aa11.43□□□□□ -0.58
SSA4YER103W YEA4P40004 342 aa11.43□□□□□ -0.58
SSA4YER103W AIR1P40507 360 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SSA4YER103W INP1Q03694 420 aa11.43□□□□□ -0.58
SSA4YER103W CST9Q06032 482 aa11.43□□□□□ -0.58
SSA4YER103W TDA6Q06466 467 aa11.43□□□□□ -0.58
SSA4YER103W VAM3Q12241 283 aa11.43□□□□□ -0.58
SSA4YER103W PAU19P0CE85 124 aa11.42□□□□□ -0.58
SSA4YER103W PAU21P0CE86 164 aa11.42□□□□□ -0.58
SSA4YER103W PAU22P0CE87 164 aa11.42□□□□□ -0.58
SSA4YER103W PAU3P25610 124 aa11.42□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SKN7P38889 622 aa11.42□□□□□ -0.58
SSA4YER103W OST3P48439 350 aa11.42□□□□□ -0.58
SSA4YER103W TGL2P54857 326 aa11.42□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SRL2Q12020 392 aa11.42□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SGA1P08019 549 aa11.41□□□□□ -0.58
SSA4YER103W YOR062CP36025 268 aa11.41□□□□□ -0.58
SSA4YER103W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SSA4YER103W ARC40P38328 384 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SSA4YER103W SMM1P53720 384 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SSA4YER103W ATC1Q04005 294 aa11.41□□□□□ -0.58
SSA4YER103W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SSA4YER103W DPB4Q04603 196 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SSA4YER103W CPR2P23285 205 aa11.41□□□□□ -0.58
SSA4YER103W PHS1P40857 217 aa11.41□□□□□ -0.58
SSA4YER103W YOL073CQ08232 322 aa11.41□□□□□ -0.58
SSA4YER103W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa11.41□□□□□ -0.58
SSA4YER103W ATP5P09457 212 aa11.4□□□□□ -0.58
SSA4YER103W CKA1P15790 372 aa11.4□□□□□ -0.58
SSA4YER103W ATG15P25641 520 aa11.4□□□□□ -0.58
SSA4YER103W OAR1P35731 278 aa11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55.9 ms