RNA–Protein interactions for RNA: YBL078C

ATG8, Transcript of Component of autophagosomes and Cvt vesicles, yeastyeast

Gene ATG8, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG8YBL078C CHL4P38907 458 aa3.59□□□□□ -1.83
ATG8YBL078C UTP18P40362 594 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
ATG8YBL078C PRM5P40476 318 aa3.59□□□□□ -1.83
ATG8YBL078C YFL067WP43537 175 aa3.59□□□□□ -1.83
ATG8YBL078C SWS2P53937 143 aa3.59□□□□□ -1.83
ATG8YBL078C VAC7P53950 1165 aa3.59□□□□□ -1.83
ATG8YBL078C SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
ATG8YBL078C TAF9Q05027 157 aa3.59□□□□□ -1.83
ATG8YBL078C ATP16Q12165 160 aa3.59□□□□□ -1.83
ATG8YBL078C JLP1Q12358 412 aa3.59□□□□□ -1.83
ATG8YBL078C BI3Q9ZZW7 517 aa3.59□□□□□ -1.83
ATG8YBL078C SNF6P18888 332 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C SEC1P30619 724 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C NTF2P33331 125 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YND1P40009 630 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C SNZ3P43545 298 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C MIC26P50087 233 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C SNZ2P53824 298 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C MRS2Q01926 470 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C PRM15Q03262 622 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C SCS7Q03529 384 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YMR166CQ03829 368 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C SEC10Q06245 871 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C DTD1Q07648 150 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C MFG1Q07684 458 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C MIM1Q08176 113 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C RRS1Q08746 203 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C MCT1Q12283 360 aa3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C TPI1P00942 248 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C STE7P06784 515 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C MSI1P13712 422 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C FBA1P14540 359 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YAK1P14680 807 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C MCK1P21965 375 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C CMK2P22517 447 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YCR043CP25361 127 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C SSO1P32867 290 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C TKL2P33315 681 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C TRM5P38793 499 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YIL067CP40514 678 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YJL213WP40896 331 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C EGT2P42835 1041 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C TRM9P49957 279 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YGL159WP53110 370 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C NRM1P53718 249 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C RHO3Q00245 231 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C ARO80Q04052 950 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C FSH2Q05015 223 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C PEX10Q05568 337 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C FAR10Q06001 478 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YPR098CQ06089 161 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YPR117WQ06116 2489 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C LOA1Q06508 300 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C VPS13Q07878 3144 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YLR126CQ12288 251 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C DCN1Q12395 269 aa3.57□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C LAA1P39526 2014 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YLR462WO13556 202 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C PHO2P07269 559 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C CBS2P14905 389 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C CPR4P25334 318 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C GIT1P25346 518 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C GPX1P36014 167 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YHL049CP38722 271 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C PTI1P39927 425 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YEL075CP39972 122 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YER189WP40104 122 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C PRE6P40303 254 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C BMT5P40493 336 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YFL064CP43540 174 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YFR057WP43625 151 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C NBP35P52920 328 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C COS10P52924 374 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YNL247WP53852 767 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C RPL22BP56628 122 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C VPS60Q03390 229 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YML018CQ03730 393 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C RIF2Q06208 395 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C ATG17Q06410 417 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C SNA4Q07549 140 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C ESA1Q08649 445 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C VIK1Q12045 647 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C HMS1Q12398 434 aa3.56□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YAL064W-BO13512 126 aa3.55□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C URA10P30402 227 aa3.55□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C AEP1P32493 518 aa3.55□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C VPS51P36116 164 aa3.55□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C GOS1P38736 223 aa3.55□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C FRT2P39734 528 aa3.55□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C NUP57P48837 541 aa3.55□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C MSO1P53604 210 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YIP3P53633 176 aa3.55□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C YNR066CP53752 436 aa3.55□□□□□ -1.84
ATG8YBL078C HEM25Q07534 307 aa3.55□□□□□ -1.84
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