RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		18.96	■□□□□ 0.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SPTLC2	O15270	562 aa		18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PLA2G4B	P0C869	781 aa		18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	EPCAM	P16422	314 aa		18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPA	Q15257	358 aa		18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		18.95	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX28	O15482	410 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP6R2	O75170	966 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TOM1L1	O75674	476 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	GLUD1	P00367	558 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	EDN1	P05305	212 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT85	P78386	507 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ZXDA	P98168	799 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	STRN3	Q13033	797 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PKP1	Q13835	747 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	KYAT1	Q16773	422 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	KLK14	Q9P0G3	267 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		18.94	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAPPC3	O43617	180 aa		18.93	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNE1	P15382	129 aa		18.93	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF131	P52739	623 aa		18.93	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	LILRA6	Q6PI73	481 aa		18.93	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		18.93	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		18.93	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		18.93	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		18.93	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		18.93	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	POMK	Q9H5K3	350 aa		18.93	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		18.93	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ABLIM1	O14639	778 aa		18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	DDIT3	P35638	169 aa		18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	NCKAP1L	P55160	1127 aa		18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPN21	Q16825	1174 aa		18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ARSH	Q5FYA8	562 aa		18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ACAP3	Q96P50	834 aa		18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	CDT1	Q9H211	546 aa		18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO10	Q9HD67	2058 aa		18.92	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC16A4	O15374	487 aa		18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	CUTA	O60888	179 aa		18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	LIG1	P18858	919 aa		18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ME1	P48163	572 aa		18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TCHP	Q9BT92	498 aa		18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	POLD4	Q9HCU8	107 aa		18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	CNTN3	Q9P232	1028 aa		18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PIGR	P01833	764 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	POU2F2	P09086	479 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	MCL1	Q07820	350 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	UPP1	Q16831	310 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	UVSSA	Q2YD98	709 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	STAM	Q92783	540 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM122A	Q96E09	287 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRX2	Q99811	253 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	APOL5	Q9BWW9	433 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	STK17A	Q9UEE5	414 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	GDA	Q9Y2T3	454 aa		18.9	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	TECTA	O75443	2155 aa		18.89	■□□□□ 0.62
HDAC10-216	ENST00000489424	SFI1	A8K8P3	1242 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	C2CD2L	O14523	706 aa		18.89	■□□□□ 0.61
HDAC10-216	ENST00000489424	CLDN3	O15551	220 aa		18.89	■□□□□ 0.61

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