RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ADAM28Q9UKQ2 775 aa8.41□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.41□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.41□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.41□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 CLIC4Q9Y696 253 aa8.41□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.41□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 USP34Q70CQ2 3546 aa8.41□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.41□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 LILRB3O75022 631 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 KIF4AO95239 1232 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ADH1AP07327 375 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MCF2P10911 925 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 KLRC2P26717 231 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 GRM5P41594 1212 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 CLCN4P51793 760 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 SMTNP53814 917 aa8.4□□□□□ -1.06
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SGMS1-201ENST00000361543 DSG1Q02413 1049 aa8.4□□□□□ -1.06
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SGMS1-201ENST00000361543 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
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SGMS1-201ENST00000361543 NAB2Q15742 525 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 USP41Q3LFD5 358 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ARSHQ5FYA8 562 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 GLRA4Q5JXX5 417 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ATL3Q6DD88 541 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ZBTB33Q86T24 672 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 RNF135Q8IUD6 432 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 CEP120Q8N960 986 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC15Q8TF66 581 aa8.4□□□□□ -1.06
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SGMS1-201ENST00000361543 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 FBXL18Q96ME1 805 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 RIPOR3Q96MK2 946 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL5Q96PQ7 755 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 TCHPQ9BT92 498 aa8.4□□□□□ -1.06
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SGMS1-201ENST00000361543 ADAM7Q9H2U9 754 aa8.4□□□□□ -1.06
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SGMS1-201ENST00000361543 PTPRHQ9HD43 1115 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.4□□□□□ -1.06
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SGMS1-201ENST00000361543 KCNG1Q9UIX4 513 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 ODF2LQ9ULJ1 636 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 MTMR6Q9Y217 621 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.4□□□□□ -1.06
SGMS1-201ENST00000361543 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.4□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 TSC2P49815 1807 aa8.4□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 DMDP11532 3685 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 H0YCG3 227 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 K7ENM7 598 aa8.39□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 TEX28O15482 410 aa8.39□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 MTHFRP42898 656 aa8.39□□□□□ -1.07
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SGMS1-201ENST00000361543 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 SPECC1Q5M775 1068 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 KIF12Q96FN5 646 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 BICD1Q96G01 975 aa8.39□□□□□ -1.07
SGMS1-201ENST00000361543 EPSTI1Q96J88 318 aa8.39□□□□□ -1.07
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