RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PDGFRBP09619 1106 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 HPCAP84074 193 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RHOT1Q8IXI2 618 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 FAM151AQ8WW52 585 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 DEFB129Q9H1M3 183 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TUFT1Q9NNX1 390 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 BARHL2Q9NY43 387 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PSMA3P25788 255 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SLC7A14Q8TBB6 771 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PKP3Q9Y446 797 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 HBP1O60381 514 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ACADMP11310 421 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 STYK1Q6J9G0 422 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 NAGPAQ9UK23 515 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RCOR1Q9UKL0 485 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 NEDD4P46934 1319 aa11.14□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 NCAPD2Q15021 1401 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-201ENST00000220888 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TYK2P29597 1187 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-201ENST00000220888 GRAMD1BQ3KR37 738 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-201ENST00000220888 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SNX5Q9Y5X3 404 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 A0A0G2JND7 137 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC53A6NM62 1247 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 MYBP10242 640 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RGS4P49798 205 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-201ENST00000220888 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 NOTUMQ6P988 496 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 C18orf8Q96DM3 657 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ZFYVE19Q96K21 471 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 OSBPL3Q9H4L5 887 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ECT2Q9H8V3 914 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 FBXL5Q9UKA1 691 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CRB1P82279 1406 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 H0Y626 953 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 GPR182O15218 404 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-201ENST00000220888 DYRK3O43781 588 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CYP2C19P33261 490 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 DEUP1Q05D60 604 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 C16orf72Q14CZ0 275 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 KRT31Q15323 416 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ALS2CLQ60I27 953 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PLEKHH3Q7Z736 793 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 TBC1D10CQ8IV04 446 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SPACA6W5XKT8 324 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 EYA4O95677 639 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-201ENST00000220888 IFT88Q13099 833 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-201ENST00000220888 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.13□□□□□ -0.63
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TRPS1-201ENST00000220888 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 EMSYQ7Z589 1322 aa11.13□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 PIK3R2O00459 728 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 IL18RAPO95256 599 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-201ENST00000220888 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 RAG1P15918 1043 aa11.12□□□□□ -0.63
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TRPS1-201ENST00000220888 ZSCAN26Q16670 478 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 ERAP2Q6P179 960 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SNX31Q8N9S9 440 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 HIPK4Q8NE63 616 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 USP33Q8TEY7 942 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SKA1Q96BD8 255 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 SNX24Q9Y343 169 aa11.12□□□□□ -0.63
TRPS1-201ENST00000220888 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa11.12□□□□□ -0.63
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