RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RnaselQ05921 735 aa13.59□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Foxred2Q3USW5 665 aa13.59□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prr18Q6PAN7 307 aa13.59□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Drd5Q8BLD9 478 aa13.59□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gtpbp10Q8K013 366 aa13.59□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ankrd49Q8VE42 238 aa13.59□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc1Q91Z38 292 aa13.59□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bap1Q99PU7 728 aa13.59□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam205aA2APU8 1308 aa13.59□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6370A0A0G2JGX9 315 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nkx1-1G3UXB3 402 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm6309L7N481 315 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Soat2O88908 525 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Serpinb2P12388 415 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 VdrP48281 422 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RetsatQ64FW2 609 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Igsf3Q6ZQA6 1194 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nsun6Q7TS68 476 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ints2Q80UK8 1198 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr35Q8BND3 1181 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NkrfQ8BY02 690 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gimap4Q99JY3 219 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 ArpinQ9D0A3 226 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptf1aQ9QX98 324 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa13.58□□□□□ -0.23
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfand4D3Z3C6 739 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cbx2P30658 519 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anxa5P48036 319 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam207aP58468 219 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 NxnP97346 435 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt26Q3TRJ4 462 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mettl17Q3U2U7 461 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Brip1Q5SXJ3 1174 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 EregQ61521 162 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp943Q6NZP4 507 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kct2Q8K201 259 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rtfdc1Q99K95 307 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Heg1E9Q7X6 1337 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Glud1P26443 558 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arl4cP61208 192 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HelqQ2VPA6 1069 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam198aQ3UY90 562 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp13Q5BKP2 858 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrfn2Q80TG9 788 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Apol9bQ8C7I4 310 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 A430089I19RikQ8C9W1 407 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pnpt1Q8K1R3 783 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 UvragQ8K245 698 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Apol9aQ8VDU3 310 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psmd6Q99JI4 389 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf181Q9CY62 165 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tlr5Q9JLF7 859 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgap42B2RQE8 841 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eef1bO70251 225 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mnat1P51949 309 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kpna2P52293 529 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PklrP53657 574 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr44Q6NVE8 915 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppfia2Q8BSS9 1257 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D9D9 101 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trpc4Q9QUQ5 974 aa13.58□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rabgap1lA6H6A9 815 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc24E9PUW8 296 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Etv6P97360 485 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mgat3Q10470 538 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim38Q5SZ99 471 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tcaf1Q8BNE1 924 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrpl2Q9D773 306 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5737A0A140LI11 423 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhox3fA2ANE1 215 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdelc2G5E897 503 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ctnnal1O88327 731 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CfhP06909 1234 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxa11P31311 313 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Meis2P97367 477 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp1r7Q3UM45 361 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nfe2l2Q60795 597 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ric8bQ80XE1 520 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kcnv1Q8BZN2 503 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sept11Q8C1B7 431 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmem145Q8C4U2 746 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pde10aQ8CA95 790 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dqx1Q924H9 718 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufaf7Q9CWG8 436 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scgb2b18A0A087WPA9 112 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akap5D3YVF0 745 aa13.57□□□□□ -0.24
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.1 ms