Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
Apol9bQ8C7I4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Apol9bQ8C7I4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Apol9bQ8C7I4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Apol9bQ8C7I4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Apol9bQ8C7I4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Apol9bQ8C7I4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Apol9bQ8C7I4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Apol9bQ8C7I4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Apol9bQ8C7I4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Apol9bQ8C7I4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Apol9bQ8C7I4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Apol9bQ8C7I4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Apol9bQ8C7I4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Apol9bQ8C7I4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Apol9bQ8C7I4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Apol9bQ8C7I4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Apol9bQ8C7I4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Apol9bQ8C7I4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Apol9bQ8C7I4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Apol9bQ8C7I4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Apol9bQ8C7I4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Apol9bQ8C7I4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Apol9bQ8C7I4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Apol9bQ8C7I4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Apol9bQ8C7I4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Apol9bQ8C7I4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Apol9bQ8C7I4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Apol9bQ8C7I4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Apol9bQ8C7I4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Apol9bQ8C7I4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Apol9bQ8C7I4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Apol9bQ8C7I4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Apol9bQ8C7I4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Apol9bQ8C7I4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Apol9bQ8C7I4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Apol9bQ8C7I4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Apol9bQ8C7I4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Apol9bQ8C7I4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Apol9bQ8C7I4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Apol9bQ8C7I4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Apol9bQ8C7I4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Apol9bQ8C7I4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Apol9bQ8C7I4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Apol9bQ8C7I4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Apol9bQ8C7I4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Apol9bQ8C7I4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Apol9bQ8C7I4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Apol9bQ8C7I4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Apol9bQ8C7I4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Apol9bQ8C7I4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Apol9bQ8C7I4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Apol9bQ8C7I4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
Apol9bQ8C7I4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Apol9bQ8C7I4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Apol9bQ8C7I4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Apol9bQ8C7I4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Apol9bQ8C7I4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Apol9bQ8C7I4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Apol9bQ8C7I4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Apol9bQ8C7I4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Apol9bQ8C7I4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Apol9bQ8C7I4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Apol9bQ8C7I4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Apol9bQ8C7I4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Apol9bQ8C7I4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Apol9bQ8C7I4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Apol9bQ8C7I4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apol9bQ8C7I4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Apol9bQ8C7I4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Apol9bQ8C7I4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Apol9bQ8C7I4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Apol9bQ8C7I4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Apol9bQ8C7I4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Apol9bQ8C7I4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Apol9bQ8C7I4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Apol9bQ8C7I4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Apol9bQ8C7I4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apol9bQ8C7I4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apol9bQ8C7I4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apol9bQ8C7I4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Apol9bQ8C7I4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Apol9bQ8C7I4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Apol9bQ8C7I4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apol9bQ8C7I4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apol9bQ8C7I4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Apol9bQ8C7I4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Apol9bQ8C7I4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Apol9bQ8C7I4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Apol9bQ8C7I4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Apol9bQ8C7I4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Apol9bQ8C7I4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Apol9bQ8C7I4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Apol9bQ8C7I4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Apol9bQ8C7I4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Apol9bQ8C7I4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Apol9bQ8C7I4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Apol9bQ8C7I4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Apol9bQ8C7I4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Apol9bQ8C7I4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.4 ms