Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,07■■■■□ 3,85
Apol9bQ8C7I4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Apol9bQ8C7I4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,36
Apol9bQ8C7I4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Apol9bQ8C7I4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,21
Apol9bQ8C7I4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3,19
Apol9bQ8C7I4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,29■■■■□ 3,08
Apol9bQ8C7I4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,85■■■■□ 3,01
Apol9bQ8C7I4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33,76■■■□□ 2,99
Apol9bQ8C7I4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,48■■■□□ 2,95
Apol9bQ8C7I4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
Apol9bQ8C7I4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Apol9bQ8C7I4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Apol9bQ8C7I4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
Apol9bQ8C7I4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Apol9bQ8C7I4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Apol9bQ8C7I4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,84
Apol9bQ8C7I4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32,71■■■□□ 2,83
Apol9bQ8C7I4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,51■■■□□ 2,8
Apol9bQ8C7I4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Apol9bQ8C7I4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Apol9bQ8C7I4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Apol9bQ8C7I4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,41■■■□□ 2,78
Apol9bQ8C7I4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
Apol9bQ8C7I4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Apol9bQ8C7I4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Apol9bQ8C7I4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Apol9bQ8C7I4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,72■■■□□ 2,67
Apol9bQ8C7I4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Apol9bQ8C7I4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Apol9bQ8C7I4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,64■■■□□ 2,66
Apol9bQ8C7I4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Apol9bQ8C7I4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Apol9bQ8C7I4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31,58■■■□□ 2,65
Apol9bQ8C7I4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,64
Apol9bQ8C7I4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31,46■■■□□ 2,63
Apol9bQ8C7I4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Apol9bQ8C7I4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Apol9bQ8C7I4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,38■■■□□ 2,61
Apol9bQ8C7I4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Apol9bQ8C7I4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31,26■■■□□ 2,59
Apol9bQ8C7I4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Apol9bQ8C7I4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Apol9bQ8C7I4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Apol9bQ8C7I4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Apol9bQ8C7I4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Apol9bQ8C7I4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,01■■■□□ 2,55
Apol9bQ8C7I4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Apol9bQ8C7I4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Apol9bQ8C7I4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Apol9bQ8C7I4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Apol9bQ8C7I4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Apol9bQ8C7I4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,82■■■□□ 2,53
Apol9bQ8C7I4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Apol9bQ8C7I4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Apol9bQ8C7I4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Apol9bQ8C7I4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Apol9bQ8C7I4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Apol9bQ8C7I4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Apol9bQ8C7I4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Apol9bQ8C7I4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Apol9bQ8C7I4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Apol9bQ8C7I4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Apol9bQ8C7I4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Apol9bQ8C7I4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Apol9bQ8C7I4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Apol9bQ8C7I4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,04■■■□□ 2,4
Apol9bQ8C7I4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Apol9bQ8C7I4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Apol9bQ8C7I4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Apol9bQ8C7I4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30■■■□□ 2,39
Apol9bQ8C7I4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Apol9bQ8C7I4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Apol9bQ8C7I4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Apol9bQ8C7I4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Apol9bQ8C7I4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Apol9bQ8C7I4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Apol9bQ8C7I4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Apol9bQ8C7I4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Apol9bQ8C7I4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Apol9bQ8C7I4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Apol9bQ8C7I4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Apol9bQ8C7I4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Apol9bQ8C7I4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Apol9bQ8C7I4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Apol9bQ8C7I4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Apol9bQ8C7I4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Apol9bQ8C7I4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Apol9bQ8C7I4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Apol9bQ8C7I4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Apol9bQ8C7I4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Apol9bQ8C7I4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Apol9bQ8C7I4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
Apol9bQ8C7I4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Apol9bQ8C7I4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
Apol9bQ8C7I4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Apol9bQ8C7I4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Apol9bQ8C7I4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Apol9bQ8C7I4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Apol9bQ8C7I4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,8 ms