Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.03■■■■■ 4
Ctnnal1O88327 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Ctnnal1O88327 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ctnnal1O88327 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ctnnal1O88327 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Ctnnal1O88327 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Ctnnal1O88327 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ctnnal1O88327 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Ctnnal1O88327 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ctnnal1O88327 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ctnnal1O88327 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ctnnal1O88327 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Ctnnal1O88327 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Ctnnal1O88327 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Ctnnal1O88327 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ctnnal1O88327 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ctnnal1O88327 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Ctnnal1O88327 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ctnnal1O88327 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Ctnnal1O88327 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ctnnal1O88327 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ctnnal1O88327 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ctnnal1O88327 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Ctnnal1O88327 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ctnnal1O88327 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ctnnal1O88327 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ctnnal1O88327 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ctnnal1O88327 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ctnnal1O88327 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ctnnal1O88327 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ctnnal1O88327 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ctnnal1O88327 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ctnnal1O88327 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ctnnal1O88327 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Ctnnal1O88327 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ctnnal1O88327 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ctnnal1O88327 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ctnnal1O88327 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Ctnnal1O88327 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Ctnnal1O88327 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Ctnnal1O88327 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ctnnal1O88327 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ctnnal1O88327 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ctnnal1O88327 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ctnnal1O88327 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ctnnal1O88327 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ctnnal1O88327 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ctnnal1O88327 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ctnnal1O88327 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ctnnal1O88327 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ctnnal1O88327 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ctnnal1O88327 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ctnnal1O88327 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ctnnal1O88327 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ctnnal1O88327 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ctnnal1O88327 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ctnnal1O88327 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ctnnal1O88327 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ctnnal1O88327 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ctnnal1O88327 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ctnnal1O88327 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ctnnal1O88327 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ctnnal1O88327 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ctnnal1O88327 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ctnnal1O88327 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ctnnal1O88327 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ctnnal1O88327 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Ctnnal1O88327 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ctnnal1O88327 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ctnnal1O88327 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ctnnal1O88327 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Ctnnal1O88327 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ctnnal1O88327 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ctnnal1O88327 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ctnnal1O88327 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Ctnnal1O88327 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ctnnal1O88327 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ctnnal1O88327 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ctnnal1O88327 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ctnnal1O88327 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ctnnal1O88327 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ctnnal1O88327 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Ctnnal1O88327 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ctnnal1O88327 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ctnnal1O88327 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ctnnal1O88327 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ctnnal1O88327 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ctnnal1O88327 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ctnnal1O88327 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ctnnal1O88327 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ctnnal1O88327 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ctnnal1O88327 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ctnnal1O88327 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ctnnal1O88327 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ctnnal1O88327 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ctnnal1O88327 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ctnnal1O88327 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ctnnal1O88327 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ctnnal1O88327 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ctnnal1O88327 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms