Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40,03■■■■■ 4
Ctnnal1O88327 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Ctnnal1O88327 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Ctnnal1O88327 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Ctnnal1O88327 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35,08■■■■□ 3,21
Ctnnal1O88327 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,92■■■■□ 3,18
Ctnnal1O88327 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,46■■■■□ 3,11
Ctnnal1O88327 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34,32■■■■□ 3,08
Ctnnal1O88327 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Ctnnal1O88327 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,01■■■■□ 3,03
Ctnnal1O88327 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Ctnnal1O88327 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Ctnnal1O88327 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,48■■■□□ 2,95
Ctnnal1O88327 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,91
Ctnnal1O88327 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Ctnnal1O88327 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Ctnnal1O88327 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,81■■■□□ 2,84
Ctnnal1O88327 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Ctnnal1O88327 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,68■■■□□ 2,82
Ctnnal1O88327 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Ctnnal1O88327 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,49■■■□□ 2,79
Ctnnal1O88327 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Ctnnal1O88327 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Ctnnal1O88327 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,39■■■□□ 2,78
Ctnnal1O88327 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Ctnnal1O88327 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Ctnnal1O88327 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Ctnnal1O88327 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,3■■■□□ 2,76
Ctnnal1O88327 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
Ctnnal1O88327 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
Ctnnal1O88327 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,25■■■□□ 2,75
Ctnnal1O88327 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
Ctnnal1O88327 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
Ctnnal1O88327 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,05■■■□□ 2,72
Ctnnal1O88327 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Ctnnal1O88327 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,91■■■□□ 2,7
Ctnnal1O88327 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,83■■■□□ 2,69
Ctnnal1O88327 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Ctnnal1O88327 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,66■■■□□ 2,66
Ctnnal1O88327 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Ctnnal1O88327 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,52■■■□□ 2,64
Ctnnal1O88327 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,62
Ctnnal1O88327 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,34■■■□□ 2,61
Ctnnal1O88327 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31,18■■■□□ 2,58
Ctnnal1O88327 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,15■■■□□ 2,58
Ctnnal1O88327 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Ctnnal1O88327 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Ctnnal1O88327 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Ctnnal1O88327 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Ctnnal1O88327 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Ctnnal1O88327 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Ctnnal1O88327 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,84■■■□□ 2,53
Ctnnal1O88327 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Ctnnal1O88327 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,77■■■□□ 2,52
Ctnnal1O88327 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Ctnnal1O88327 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,73■■■□□ 2,51
Ctnnal1O88327 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Ctnnal1O88327 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Ctnnal1O88327 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Ctnnal1O88327 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Ctnnal1O88327 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Ctnnal1O88327 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Ctnnal1O88327 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Ctnnal1O88327 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Ctnnal1O88327 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Ctnnal1O88327 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Ctnnal1O88327 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Ctnnal1O88327 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Ctnnal1O88327 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Ctnnal1O88327 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Ctnnal1O88327 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,25■■■□□ 2,43
Ctnnal1O88327 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Ctnnal1O88327 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Ctnnal1O88327 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Ctnnal1O88327 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Ctnnal1O88327 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ctnnal1O88327 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ctnnal1O88327 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ctnnal1O88327 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Ctnnal1O88327 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Ctnnal1O88327 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Ctnnal1O88327 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
Ctnnal1O88327 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ctnnal1O88327 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ctnnal1O88327 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,95■■■□□ 2,38
Ctnnal1O88327 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ctnnal1O88327 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ctnnal1O88327 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Ctnnal1O88327 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Ctnnal1O88327 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Ctnnal1O88327 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Ctnnal1O88327 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Ctnnal1O88327 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
Ctnnal1O88327 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ctnnal1O88327 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ctnnal1O88327 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Ctnnal1O88327 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Ctnnal1O88327 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Ctnnal1O88327 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ctnnal1O88327 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms