Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B7

Sept11, Septin-11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept11Q8C1B7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,83■■■■□ 3,17
Sept11Q8C1B7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Sept11Q8C1B7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Sept11Q8C1B7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Sept11Q8C1B7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Sept11Q8C1B7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,69■■■□□ 2,66
Sept11Q8C1B7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,96■■■□□ 2,55
Sept11Q8C1B7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,86■■■□□ 2,53
Sept11Q8C1B7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Sept11Q8C1B7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Sept11Q8C1B7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,28■■■□□ 2,44
Sept11Q8C1B7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Sept11Q8C1B7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Sept11Q8C1B7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Sept11Q8C1B7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Sept11Q8C1B7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,78■■■□□ 2,36
Sept11Q8C1B7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Sept11Q8C1B7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Sept11Q8C1B7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Sept11Q8C1B7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Sept11Q8C1B7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Sept11Q8C1B7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Sept11Q8C1B7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Sept11Q8C1B7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Sept11Q8C1B7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Sept11Q8C1B7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Sept11Q8C1B7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Sept11Q8C1B7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Sept11Q8C1B7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Sept11Q8C1B7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Sept11Q8C1B7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Sept11Q8C1B7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Sept11Q8C1B7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Sept11Q8C1B7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Sept11Q8C1B7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Sept11Q8C1B7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Sept11Q8C1B7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Sept11Q8C1B7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,62■■■□□ 2,17
Sept11Q8C1B7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Sept11Q8C1B7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Sept11Q8C1B7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Sept11Q8C1B7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Sept11Q8C1B7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Sept11Q8C1B7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Sept11Q8C1B7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Sept11Q8C1B7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Sept11Q8C1B7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Sept11Q8C1B7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Sept11Q8C1B7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Sept11Q8C1B7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Sept11Q8C1B7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Sept11Q8C1B7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Sept11Q8C1B7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Sept11Q8C1B7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Sept11Q8C1B7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Sept11Q8C1B7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Sept11Q8C1B7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Sept11Q8C1B7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Sept11Q8C1B7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Sept11Q8C1B7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Sept11Q8C1B7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Sept11Q8C1B7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Sept11Q8C1B7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Sept11Q8C1B7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27,52■■■□□ 2
Sept11Q8C1B7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Sept11Q8C1B7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Sept11Q8C1B7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Sept11Q8C1B7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Sept11Q8C1B7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Sept11Q8C1B7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Sept11Q8C1B7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Sept11Q8C1B7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,39■■□□□ 1,97
Sept11Q8C1B7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Sept11Q8C1B7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Sept11Q8C1B7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Sept11Q8C1B7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Sept11Q8C1B7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Sept11Q8C1B7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Sept11Q8C1B7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Sept11Q8C1B7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Sept11Q8C1B7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Sept11Q8C1B7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Sept11Q8C1B7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Sept11Q8C1B7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Sept11Q8C1B7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Sept11Q8C1B7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Sept11Q8C1B7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Sept11Q8C1B7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Sept11Q8C1B7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Sept11Q8C1B7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Sept11Q8C1B7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,95■■□□□ 1,9
Sept11Q8C1B7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Sept11Q8C1B7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Sept11Q8C1B7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Sept11Q8C1B7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Sept11Q8C1B7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Sept11Q8C1B7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Sept11Q8C1B7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Sept11Q8C1B7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Sept11Q8C1B7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,8 ms