Protein–RNA interactions for Protein: P97346

Nxn, Nucleoredoxin, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NxnP97346 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NxnP97346 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NxnP97346 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NxnP97346 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NxnP97346 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
NxnP97346 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NxnP97346 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NxnP97346 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NxnP97346 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NxnP97346 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NxnP97346 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NxnP97346 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NxnP97346 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
NxnP97346 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NxnP97346 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NxnP97346 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NxnP97346 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NxnP97346 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NxnP97346 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NxnP97346 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NxnP97346 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NxnP97346 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NxnP97346 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NxnP97346 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NxnP97346 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NxnP97346 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NxnP97346 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NxnP97346 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NxnP97346 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NxnP97346 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NxnP97346 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NxnP97346 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NxnP97346 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NxnP97346 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NxnP97346 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NxnP97346 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NxnP97346 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NxnP97346 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NxnP97346 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NxnP97346 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NxnP97346 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NxnP97346 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NxnP97346 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NxnP97346 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NxnP97346 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NxnP97346 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NxnP97346 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NxnP97346 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NxnP97346 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NxnP97346 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NxnP97346 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NxnP97346 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NxnP97346 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NxnP97346 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NxnP97346 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NxnP97346 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NxnP97346 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NxnP97346 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NxnP97346 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NxnP97346 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NxnP97346 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NxnP97346 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NxnP97346 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NxnP97346 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NxnP97346 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NxnP97346 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NxnP97346 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NxnP97346 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NxnP97346 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NxnP97346 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NxnP97346 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NxnP97346 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NxnP97346 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NxnP97346 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NxnP97346 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NxnP97346 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NxnP97346 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NxnP97346 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NxnP97346 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NxnP97346 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NxnP97346 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NxnP97346 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NxnP97346 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NxnP97346 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NxnP97346 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NxnP97346 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NxnP97346 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NxnP97346 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NxnP97346 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NxnP97346 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NxnP97346 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NxnP97346 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NxnP97346 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NxnP97346 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NxnP97346 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NxnP97346 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NxnP97346 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NxnP97346 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NxnP97346 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NxnP97346 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms