Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRJ4

Krt26, Keratin, type I cytoskeletal 26, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt26Q3TRJ4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,07■■■■□ 3,36
Krt26Q3TRJ4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,82■■■■□ 3,16
Krt26Q3TRJ4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,78■■■■□ 3
Krt26Q3TRJ4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,65■■■□□ 2,98
Krt26Q3TRJ4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Krt26Q3TRJ4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Krt26Q3TRJ4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,43■■■□□ 2,78
Krt26Q3TRJ4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,28■■■□□ 2,76
Krt26Q3TRJ4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,26■■■□□ 2,76
Krt26Q3TRJ4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Krt26Q3TRJ4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,65■■■□□ 2,66
Krt26Q3TRJ4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,59■■■□□ 2,65
Krt26Q3TRJ4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,46■■■□□ 2,63
Krt26Q3TRJ4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Krt26Q3TRJ4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Krt26Q3TRJ4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Krt26Q3TRJ4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Krt26Q3TRJ4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Krt26Q3TRJ4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Krt26Q3TRJ4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Krt26Q3TRJ4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,9■■■□□ 2,54
Krt26Q3TRJ4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Krt26Q3TRJ4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Krt26Q3TRJ4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Krt26Q3TRJ4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Krt26Q3TRJ4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,57■■■□□ 2,48
Krt26Q3TRJ4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Krt26Q3TRJ4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Krt26Q3TRJ4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Krt26Q3TRJ4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Krt26Q3TRJ4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Krt26Q3TRJ4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,27■■■□□ 2,44
Krt26Q3TRJ4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Krt26Q3TRJ4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Krt26Q3TRJ4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Krt26Q3TRJ4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Krt26Q3TRJ4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Krt26Q3TRJ4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Krt26Q3TRJ4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Krt26Q3TRJ4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Krt26Q3TRJ4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Krt26Q3TRJ4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Krt26Q3TRJ4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Krt26Q3TRJ4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,71■■■□□ 2,35
Krt26Q3TRJ4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Krt26Q3TRJ4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,65■■■□□ 2,34
Krt26Q3TRJ4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Krt26Q3TRJ4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Krt26Q3TRJ4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Krt26Q3TRJ4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Krt26Q3TRJ4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Krt26Q3TRJ4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Krt26Q3TRJ4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Krt26Q3TRJ4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,98■■■□□ 2,23
Krt26Q3TRJ4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Krt26Q3TRJ4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Krt26Q3TRJ4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Krt26Q3TRJ4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Krt26Q3TRJ4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Krt26Q3TRJ4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Krt26Q3TRJ4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
Krt26Q3TRJ4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Krt26Q3TRJ4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Krt26Q3TRJ4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Krt26Q3TRJ4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Krt26Q3TRJ4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Krt26Q3TRJ4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Krt26Q3TRJ4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Krt26Q3TRJ4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Krt26Q3TRJ4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Krt26Q3TRJ4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Krt26Q3TRJ4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Krt26Q3TRJ4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Krt26Q3TRJ4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Krt26Q3TRJ4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Krt26Q3TRJ4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Krt26Q3TRJ4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Krt26Q3TRJ4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Krt26Q3TRJ4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Krt26Q3TRJ4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Krt26Q3TRJ4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Krt26Q3TRJ4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Krt26Q3TRJ4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Krt26Q3TRJ4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Krt26Q3TRJ4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Krt26Q3TRJ4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Krt26Q3TRJ4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Krt26Q3TRJ4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Krt26Q3TRJ4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Krt26Q3TRJ4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Krt26Q3TRJ4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Krt26Q3TRJ4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Krt26Q3TRJ4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Krt26Q3TRJ4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Krt26Q3TRJ4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,99■■■□□ 2,07
Krt26Q3TRJ4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Krt26Q3TRJ4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Krt26Q3TRJ4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Krt26Q3TRJ4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Krt26Q3TRJ4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
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