Protein–RNA interactions for Protein: P61208

Arl4c, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4cP61208 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Arl4cP61208 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Arl4cP61208 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Arl4cP61208 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Arl4cP61208 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Arl4cP61208 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Arl4cP61208 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Arl4cP61208 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Arl4cP61208 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Arl4cP61208 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Arl4cP61208 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Arl4cP61208 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Arl4cP61208 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Arl4cP61208 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Arl4cP61208 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Arl4cP61208 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Arl4cP61208 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Arl4cP61208 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Arl4cP61208 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Arl4cP61208 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Arl4cP61208 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Arl4cP61208 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Arl4cP61208 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Arl4cP61208 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Arl4cP61208 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Arl4cP61208 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Arl4cP61208 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Arl4cP61208 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Arl4cP61208 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Arl4cP61208 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Arl4cP61208 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Arl4cP61208 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Arl4cP61208 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Arl4cP61208 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Arl4cP61208 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Arl4cP61208 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Arl4cP61208 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Arl4cP61208 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Arl4cP61208 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Arl4cP61208 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Arl4cP61208 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Arl4cP61208 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Arl4cP61208 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Arl4cP61208 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Arl4cP61208 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Arl4cP61208 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Arl4cP61208 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Arl4cP61208 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Arl4cP61208 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Arl4cP61208 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Arl4cP61208 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Arl4cP61208 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Arl4cP61208 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Arl4cP61208 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Arl4cP61208 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Arl4cP61208 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Arl4cP61208 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Arl4cP61208 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Arl4cP61208 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Arl4cP61208 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Arl4cP61208 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Arl4cP61208 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arl4cP61208 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arl4cP61208 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arl4cP61208 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Arl4cP61208 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Arl4cP61208 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Arl4cP61208 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Arl4cP61208 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Arl4cP61208 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arl4cP61208 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Arl4cP61208 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Arl4cP61208 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Arl4cP61208 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Arl4cP61208 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Arl4cP61208 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Arl4cP61208 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Arl4cP61208 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Arl4cP61208 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Arl4cP61208 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Arl4cP61208 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arl4cP61208 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Arl4cP61208 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Arl4cP61208 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Arl4cP61208 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Arl4cP61208 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Arl4cP61208 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Arl4cP61208 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Arl4cP61208 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Arl4cP61208 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Arl4cP61208 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Arl4cP61208 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Arl4cP61208 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Arl4cP61208 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Arl4cP61208 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Arl4cP61208 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Arl4cP61208 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Arl4cP61208 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Arl4cP61208 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Arl4cP61208 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms